Anestesia e hibridação experimental em laboratório de espécies do gênero Crassostrea (Bivalvia: Ostreidae).

Com o objetivo de contribuir com conhecimentos sobre a reprodução em laboratório de ostras nativas do gênero Crassostrea e estudar as possíveis interações entre as espécies cultivadas no Brasil, o presente trabalho avaliou: 1) um método de anestesia e amostragem de tecido gonádico sem sacrifício de animais para a análise do estado de desenvolvimento sexual; 2) a hibridação entre a espécie de ostra do Pacífico, Crassostrea gigas, e as espécies nativas, C. rhizophorae e C. gasar; e 3) o uso de marcadores de DNA mitocondrial e nuclear para a identificação de híbridos. Como resultados, o uso de Cloreto de Magnésio (50 g.L-1), aplicado à água do mar, promoveu o relaxamento muscular e a abertura das valvas nas três espécies de ostras estudadas, permitindo biópsias de tecido gonádico com seringas e agulhas e a determinação do sexo dos animais. Os procedimentos de anestesia e amostragem de tecido não causaram mortalidade nestes indivíduos que apresentaram 100% de sobrevivência após 10 dias. Após o uso do anestésico, também não foram observadas alterações na atividade reprodutiva e na geração de larvas-D de C. gigas. A partir dos cruzamentos recíprocos entre C. gigas, C. rhizophorae e C. gasar, houve sucesso assimétrico na fecundação de oócitos de C. rhizophorae (R) com espermatozoides de C. gigas (G), oócitos de C. gasar (B) com espermatozoides de C. gigas (G) e oócitos de C. rhizophorae (R) com espermatozoides de C. gasar (B). A compatibilidade unidirecional de gametas entre as três espécies resultou na formação de larvas híbridas que apresentaram crescimento similar à espécie materna até sete dias de idade. Após este período, as larvas pararam de crescer e morreram. As análises de marcadores moleculares confirmaram que as progênies RG eram híbridos verdadeiros e continham o DNA de ambas as espécies parentais em seu genoma. A inviabilidade no desenvolvimento de larvas híbridas interespecíficas em laboratório sugere que a incompatibilidade genômica é suficiente para evitar o risco de hibridação natural entre C. gigas e as espécies nativas C. rhizophorae e C. gasar.

Estudio molecular en dos hermanas afectadas por ictiosis congénita autosómica recesiva : descripción de una nueva mutación causal en TGM1

Se describe la variante homocigota c.320-2A>G de TGM1 en dos hermanas con ictiosis congénita autosómica recesiva. El clonaje de los transcritos generados por esta variante permitió identificar tres mecanismos moleculares de splicing alternativos.

Identificação de regiões genômicas por GWAS em trigo associadas à tolerância à seca - primeiros resultados.

2016

Avaliação do desempenho relativo de bancos de dados NoSQL para arquivos de genótipos.

A bioinformática e a genômica trabalham com bases de dados fora do padrão tradicional ou clássico que, por sua vez, caracterizam-se pela organizacão tabular e pelo tratamento destas em SGBDRs. Arquivos de genótipos são exemplos de bases de dados não clássicas e são caracterizados por serem gerados como arquivos textos, com dados desbalanceados, com alta dimensionalidade e por ocuparem muito espaço, entre outros aspectos. Os SGBDRs não têm se mostrado uma boa solucão para o tratamento de tais bases e, portanto, o presente trabalho busca avaliar o desempenho relativo entre bancos de dados NoSQL que representam duas famílias de diferentes modelo de dados, a partir de cenários de teste para a manipulação de arquivos de genótipo.

Genome-wide detection of CNVs and their association with meat tenderness in Nelore cattle.

Brazil is one of the largest beef producers and exporters in the world with the Nelore breed representing the vast majority of Brazilian cattle (Bos taurus indicus). Despite the great adaptability of the Nelore breed to tropical climate, meat tenderness (MT) remains to be improved. Several factors including genetic composition can influence MT. In this article, we report a genome-wide analysis of copy number variation (CNV) inferred from Illumina1 High Density SNP-chip data for a Nelore population of 723 males. We detected >2,600 CNV regions (CNVRs) representing 6.5% of the genome. Comparing our results with previous studies revealed an overlap in 1400 CNVRs (>50%). A total of 1,155 CNVRs (43.6%) overlapped 2,750 genes. They were enriched for processes involving guanosine triphosphate (GTP), previously reported to influence skeletal muscle physiology and morphology. Nelore CNVRs also overlapped QTLs for MT reported in other breeds (8.9%, 236 CNVRs) and from a previous study with this population (4.1%, 109 CNVRs). Two CNVRs were also proximal to glutathione metabolism genes that were previously associated with MT. Genome-wide association study of CN state with estimated breeding values derived from meat shear force identified 6 regions, including a region on BTA3 that contains genes of the cAMP and cGMP pathway. Ten CNVRs that overlapped regions associated with MT were successfully validated by qPCR. Our results represent the first comprehensive CNV study in Bos taurus indicus cattle and identify regions in which copy number changes are potentially of importance for the MT phenotype.

Resumos...

Ação antibacteriana in vitro de extratos vegetais de plantas do Bioma Pampa; Adubação nitrogenada na produção de Tifton 85; Análise funcional da congruência de marcadores SNPs entre estudos de associação genômica ampla para a característica de resistência de bovinos ao carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus; Avaliação de capim-sudão BRS Estribo quando manejado por altura e pastejado por vacas em lactação; Avaliação de carcaças de animais da raça Charolês e de suas cruzas: dados parciais; Avaliação de genótipos de azevém na região da Campanha gaúcha; Avaliação de genótipos de Dactylis glomerata na região da Campanha gaúcha; Avaliação de Panicum maximum em Bagé - RS; Avaliação do crescimento e desenvolvimento de capim-sudão BRS Estribo sob diferentes disponibilidades hídricas; Avaliação do emprego da termografia em estimativas de carga parasitária de Rhipicephalus (Boophilus) microplus em bovinos; Avaliação in vivo da atividade anti-helmíntica de Senecio brasiliensis e de Acacia mearnsii em ovinos experimentalmente infectados; Comparação da resposta humoral de bovinos da raça Braford resistentes e sensíveis ao Rhipicephalus (Boophilus) microplus submetidos a infestações artificiais; Comportamento ingestivo de bovinos de corte em pastagem natural com diferentes níveis de intensificação; Descrição e evolução da infestação do capim-annoni utilizando o método de interceptação na linha; Desempenho de terneiros(as) das raças Angus e Braford em diferentes propriedades de pecuaristas familiares do Rio Grande do Sul; Dessecação na linha: implicações na produção de sorgo forrageiro no Método Integrado para Recuperação de Pastagens - Mirapasto; Dessecação na linha: implicações no estabelecimento de plantas forrageiras no Método Integrado para Recuperação de Pastagens - Mirapasto; Efeito do tempo de secagem e análise sequencial sobre a determinação de fdn e fda em forragens utilizando bolsas de filtro Efeito in vitro de extratos vegetais sobre a inibição da migração de larvas infectantes de Haemonchus contortus