The Challenges of Antimicrobial Resistance in Brazil

Brazil is a country with continental proportions with high geographic and economic diversity. Despite its medical centers of excellence, antimicrobial resistance poses a major therapeutic challenge. Rates of methicillin-resistant Staphylococcus aureus are up to 60% and are related to an endemic Brazilian clone. Local resistance to vancomycin in Enterococci was first related to Enterococcus faecalis, which differs from European and American epidemiology. Also, local Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli isolates producing extended-spectrum beta-lactamases have a much higher prevalence (40%-50% and 10%-18%, respectively). Carbapenem resistance among the enterobacteriaceae group is becoming a major problem, and K. pneumoniae carbapenemase isolates have been reported in different states. Among nonfermenters, carbapenem resistance is strongly related to SPM-1 (Pseudomonasaeruginosa) and OXA-23 (Acinetobacter baumannii complex) enzymes, and a colistin-only susceptible phenotype has also emerged in these isolates, which is worrisome. Local actions without loosing the global resistance perspective will demand multidisciplinary actions, new policies, and political engagement.

Meropenem versus piperacillin-tazobactam for definitive treatment of bloodstream infections due to ceftriaxone non-susceptible Escherichia coli and Klebsiella spp (the MERINO trial): study protocol for a randomised controlled trial

BACKGROUND: Gram-negative bacteria such as Escherichia coli or Klebsiella spp. frequently cause bloodstream infections. There has been a worldwide increase in resistance in these species to antibiotics such as third generation cephalosporins, largely driven by the acquisition of extended-spectrum beta-lactamase or plasmid-mediated AmpC enzymes. Carbapenems have been considered the most effective therapy for serious infections caused by such resistant bacteria; however, increased use creates selection pressure for carbapenem resistance, an emerging threat arising predominantly from the dissemination of genes encoding carbapenemases. Recent retrospective data suggest that beta-lactam/beta-lactamase inhibitor combinations, such as piperacillin-tazobactam, may be non-inferior to carbapenems for the treatment of bloodstream infection caused by extended-spectrum beta-lactamase-producers, if susceptible in vitro. This study aims to test this hypothesis in an effort to define carbapenem-sparing alternatives for these infections.

METHODS/DESIGN: The study will use a multicentre randomised controlled open-label non-inferiority trial design comparing two treatments, meropenem (standard arm) and piperacillin-tazobactam (carbapenem-sparing arm) in adult patients with bacteraemia caused by E. coli or Klebsiella spp. demonstrating non-susceptibility to third generation cephalosporins. Recruitment is planned to occur in sites across three countries (Australia, New Zealand and Singapore). A total sample size of 454 patients will be required to achieve 80% power to determine non-inferiority with a margin of 5%. Once randomised, definitive treatment will be for a minimum of 4 days, but up to 14 days with total duration determined by treating clinicians. Data describing demographic information, antibiotic use, co-morbid conditions, illness severity, source of infection and other risk factors will be collected. Vital signs, white cell count, use of vasopressors and days to bacteraemia clearance will be recorded up to day 7. The primary outcome measure will be mortality at 30 days, with secondary outcomes including days to clinical and microbiological resolution, microbiological failure or relapse, isolation of a multi-resistant organism or Clostridium difficile infection.

Aspectos microbiológicos da bile de pacientes com suspeita de coledocolilitíase e suas repercussões no tratamento das infecções biliares

A infecção das vias biliares é uma doença freqüente com alta morbidade e mortalidade, que pode variar de 10 a 60% dependendo de sua gravidade. A causa mais comum desta infecção é a presença de cálculos na via biliar principal que propicia o surgimento de bacteriobilia. O profundo conhecimento das características microbiológicas da bile nos casos de coledocolitíase e infecção das vias biliares são fundamentais para o melhor diagnóstico desta infecção e escolha da antibioticoterapia a ser instituída. Assim, o objetivo deste estudo foi de caracterizar os principais aspectos microbiológicos da bile dos pacientes com e sem coledocolitíase e avaliar sua importância na escolha dos antimicrobianos para o tratamento da infecção das vias biliares. Foram analisados 33 pacientes que foram divididos em um grupo de 10 pacientes sem coledocolitíase (grupo controle) no momento da Colangiografia Endoscópica (CPER) e em outro grupo de 23 pacientes com coledocolitíase. A bile de todos os pacientes foi coletada no início do procedimento endoscópico, através de catater introduzido na via biliar. O exame de microscopia direta com coloração de Gram e as culturas da bile foram negativas nos 10 pacientes que não apresentaram coledocolitíase durante a CPER. Dos 23 pacientes com cálculos na via biliar principal, 19 (83%) apresentaram culturas positivas. Desses 19 pacientes com culturas de bile positivas, 18 (94,7%) apresentaram microorganismos detectáveis à microscopia direta com coloração de Gram. Apenas um paciente apresentou crescimento de germe anaeróbio (Bacteroides fragilis). O cultivo de 28 bactérias teve predominância de microorganismos Gram negativos (18 bactérias- 64,3%). Os germes isolados foram E. coli (9, 32,1%), Klebsiella pneumoniae (5, 17,9%), Enterococcus faecalis (5, 17,9%), Streptococcus alfa-haemoliticus (3, 10,7%), Streptococcus viridans (2, 7,1%), Enterobacter cloacae (2, 7,1%), Panteona aglomerans (1, 3,6%) e Pseudomonas aeruginosa (1, 3,6%). Todos os pacientes com microorganismos detectados pela microscopia direta com coloração de Gram tiveram crescimento bacteriano em suas culturas, por outro lado nenhum paciente com cultura negativa apresentou microoorganismos à microsopia direta ( p= 0,0005). Nesses casos, a microsopia direta apresentou uma especificidade de 100% e sensibilidade de 80%. A análise quantitativa das culturas da bile mostrou que das 19 culturas positivas, 12 (63,2%) tiveram pelo menos um germe com contagem superior a 105 ufc/ml. Todas as bactérias Gram positivas isoladas foram sensíveis à ampicilina, da mesma forma que todas as Gram negativas foram sensíveis aos aminoglicosídeos. Os achados deste estudo demonstram uma boa correlação entre a microscopia direta da bile com coloração de Gram e os achados bacteriológicos das culturas da bile coletada por colangiografia endoscópica retrógrada. O esquema terapêutico antimicrobiano tradicionalmente empregado em nosso hospital, que inclui a combinação de ampicilina e gentamicina, parece ser adequado, pois apresenta eficácia terapêutica contra os principais microorganismos responsáveis pela infecção das vias biliares.

Formação de biofilmes em diferentes materiais utilizados na indústria de processamento de leite

Biofilmes bacterianos na indústria de alimentos freqüentemente são prejudiciais, uma vez que podem abrigar patógenos e deteriorantes que contaminam os produtos. Este trabalho se propôs a avaliar e correlacionar o papel dos fatores de adesão e da hidrofobicidade na formação de biofilmes em diversos materiais. Leite in natura foi aliquotado em tubos contendo corpos de prova constituídos de vidro, polipropileno, aço inoxidável e pano de algodão e incubados em 10 °C e 25 °C. Após 2 h, 5 h e 8 h de contato, as células não aderidas foram removidas da superfície dos materiais, e as aderidas contadas em PCA. Foram isolados e identificados microrganismos dos biofilmes, sendo verificada a produção de cápsula (coloração com vermelho congo), fímbria (hemaglutinação em placa), hemolisinas (ágar sangue) e proteases (ágar leite). As hidrofobicidades celular e dos materiais foram determinadas pelos testes de agregação com sulfato de amônio e do ângulo do raio da gota séssil, respectivamente. Verificou-se a adesão de consórcios formados por E. coli, S. aureus e B. cereus. Os 103 isolados obtidos pertencem, principalmente, a espécies da família Enterobacteriaceae (46) e do gênero Staphylococcus (45). Na produção de fatores de virulência, 50,4% dos isolados produziram cápsula, 48,5% produziram fímbria, 55,3% hemolisina e 20,3% proteases. Dos microrganismos Gram-positivos e Gram-negativos, 86,6% e 84,4% foram positivos para o teste de hidrofobicidade, respectivamente. O aço inoxidável foi o material mais hidrofóbico testado, seguido por polipropileno e vidro. A temperatura de 25 °C e o polipropileno foram os maiores favorecedores de adesão dos consórcios bacterianos.

Risco à saúde representado pelo consumo de leite cru comercializado clandestinamente

Foram submetidas às contagens de microrganismos mesófilos, Staphylococccus coagulase positiva, e às determinações do número mais provável (NMP) de coliformes totais e de coliformes fecais, 60 amostras de leite cru comercializado clandestinamente nos Municípios de Botucatu e de São Manuel, Estado de São Paulo, Brasil. Os resultados obtidos evidenciaram a ocorrência de 41 (68,3%) e 50 (83,3%) amostras com contagens de microrganismos mesófilos e de coliformes totais, respectivamente, acima dos limites máximos estabelecidos pelo Ministério da Saúde para o leite pasteurizado tipo C. Evidenciaram, ainda, a presença de 30 (50,0%) e 11 (18,3%) amostras contaminadas por cepas de Staphylococcus coagulase positiva e por coliformes fecais, respectivamente. Apenas 5 (8,3%) amostras mostraram-se dentro dos referidos padrões legais.

Emended description of Yersinia massiliensis

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Potential tuberculostatic agents. Topliss application on benzoic acid [(5-nitro-thiophen-2-yl)-methylene]-hydrazide series

Nitroaromatic compounds such as nifuroxazide are used in many human enteropathogenic bacteria infections without causing an increase in the plasmidial antibiotic resistance of the aerobic Gram-negative intestinal Enterobacteriaceae. For these reasons, these compounds have been synthesized using the rational approach of Topliss' decision tree. Generally. this approach allows us to obtain the most active derivative from the series in a few steps. These compounds were tested against Mycobacterium tuberculosis in vitro and the most active of the series identified. A new lead for potential tuberculostatic activity has been predicted and will be used in further QSAR studies. (C) 2002 Elsevier B.V. Ltd. All rights reserved.

Peritonitis in recent years: clinical findings and predictors of treatment response of 170 episodes at a single Brazilian center

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Microbiological evaluation of different strategies for management of snakes in captivity

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Microbiological Evaluation of Chicken Carcasses in an Immersion Chilling System with Water Renewal at 8 and 16 Hours

Since 2004, Brazil has been the leading exporter of chicken. Because of the importance of this sector in the Brazilian economy, food safety must be ensured by control and monitoring of the production stages susceptible to contamination, such as the chilling process. The goal of this study was to evaluate changes in microbial levels on chicken carcasses and in chilling water after immersion in a chilling system for 8 and 16 h during commercial processing. An objective of the study was to encourage discussion regarding the Brazilian Ministry of Agriculture Livestock and Food Supply regulation that requires chicken processors to completely empty, clean, and disinfect each tank of the chilling system after every 8-h shift. Before and after immersion carcasses were collected and analyzed for mesophilic bacteria, Enterobacteriaceae, conforms, and Escherichia coli. Samples of water from the chilling system were also analyzed for residual free chlorine. The results do not support required emptying of the chiller tank after 8 h; these tanks could be emptied after 16 h. The results for all carcasses tested at the 8- and 16-h time points indicated no significant differences in the microbiological indicators evaluated. These data provide both technical and scientific support for discussing changes in federal law regarding the management of immersion chilling water systems used as part of the poultry processing line.

Monitoramento de micro-organismos indicadores de higiene em linha de abate de bovinos de um matadouro-frigorífico habilitado à exportação no oeste do Paraná

Indicators microorganisms can be used as a method for evaluating the sanitary quality of food products, indicating the suitability of conditions for obtaining, processing and storage of food. This study sought to evaluate surface contamination of cattle carcasses that come from a slaughter plant under Federal Inspection in western Parana by mesophilic bacteria (AM), Enterobacteriaceae (EB), coliform at 35 degrees C (TC) and E. coli (EC). Surface samples were collected from 25 carcasses, each at 4 different points of slaughter, for non-destructive method. The samples were diluted in decimal scale and incubated in Petrifilm (R) plates. Were found averages of 1.46; 0.3; 0.23 and 0.21 log CFU / cm (2) for AM, EB, CT and EC, respectively. The values to be found were well below those recommended by the decision 471/2001 of the European Union and several other authors surveyed, indicating the effectiveness of the hygienic process industry.

Occurrence of yeasts, pseudomonads and enteric bacteria in the oral cavity of patients undergoing head and neck radiotherapy

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Occurrence of yeasts, enterococci and other enteric bacteria in subgingival biofilm of HIV-positive patients with chronic gingivitis and necrotizing periodontitis

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Mucosa-associated but not luminal Escherichia coli is augmented in Crohn's disease and ulcerative colitis

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)