Semantic Fluency in Mild and Moderate Alzheimer's Disease

Alzheimer's disease (AD) is characterized by an impairment of the semantic memory responsible for processing meaning-related knowledge. This study was aimed at examining how Finnish-speaking healthy elderly subjects (n = 30) and mildly (n=20) and moderately (n = 20) demented AD patients utilize semantic knowledge to performa semantic fluency task, a method of studying semantic memory. In this task subjects are typically given 60 seconds to generate words belonging to the semantic category of animals. Successful task performance requires fast retrieval of subcategory exemplars in clusters (e.g., farm animals: 'cow', 'horse', 'sheep') and switching between subcategories (e.g., pets, water animals, birds, rodents). In this study, thescope of the task was extended to cover various noun and verb categories. The results indicated that, compared with normal controls, both mildly and moderately demented AD patients showed reduced word production, limited clustering and switching, narrowed semantic space, and an increase in errors, particularly perseverations. However, the size of the clusters, the proportion of clustered words, and the frequency and prototypicality of words remained relatively similar across the subject groups. Although the moderately demented patients showed a poor eroverall performance than the mildly demented patients in the individual categories, the error analysis appeared unaffected by the severity of AD. The results indicate a semantically rather coherent performance but less specific, effective, and flexible functioning of the semantic memory in mild and moderate AD patients. The findings are discussed in relation to recent theories of word production and semantic representation. Keywords: semantic fluency, clustering, switching, semantic category, nouns, verbs, Alzheimer's disease

Estimation and partitioning of polygenic variation captured by common SNPs for Alzheimer's disease, multiple sclerosis and endometriosis

Common diseases such as endometriosis (ED), Alzheimer's disease (AD) and multiple sclerosis (MS) account for a significant proportion of the health care burden in many countries. Genome-wide association studies (GWASs) for these diseases have identified a number of individual genetic variants contributing to the risk of those diseases. However, the effect size for most variants is small and collectively the known variants explain only a small proportion of the estimated heritability. We used a linear mixed model to fit all single nucleotide polymorphisms (SNPs) simultaneously, and estimated genetic variances on the liability scale using SNPs from GWASs in unrelated individuals for these three diseases. For each of the three diseases, case and control samples were not all genotyped in the same laboratory. We demonstrate that a careful analysis can obtain robust estimates, but also that insufficient quality control (QC) of SNPs can lead to spurious results and that too stringent QC is likely to remove real genetic signals. Our estimates show that common SNPs on commercially available genotyping chips capture significant variation contributing to liability for all three diseases. The estimated proportion of total variation tagged by all SNPs was 0.26 (SE 0.04) for ED, 0.24 (SE 0.03) for AD and 0.30 (SE 0.03) for MS. Further, we partitioned the genetic variance explained into five categories by a minor allele frequency (MAF), by chromosomes and gene annotation. We provide strong evidence that a substantial proportion of variation in liability is explained by common SNPs, and thereby give insights into the genetic architecture of the diseases.

A phosphorylation-induced turn defines the Alzheimer's disease AT8 antibody epitope on the tau protein

Post mortem biochemical staging of Alzheimer’s disease is currently based on immunochemical analysis of brain slices with the AT8 antibody. The epitope of AT8 is described around the pSer202/pThr205 region of the hyperphosphorylated form of the neuronal protein tau. In this study, NMR spectroscopy was used to precisely map the AT8 epitope on phosphorylated tau, and derive its defining structural features by a combination of NMR analyses and molecular dynamics. A particular turn conformation is stabilized by a hydrogen bond of the phosphorylated Thr205 residue to the amide proton of Gly207, and is further stabilized by the two Arg residues opposing the pSer202/pThr205.

Interaction of A beta peptide (1-40) with amino acid aluminium complexes: relevance to Alzheimer's disease

A beta (39-43 aminoacid residues) is the principal peptide component of amyloid deposits in Alzheimer's disease (AD). A beta peptide is derived from the amyloid precursor protein (APP) in which mutations give rise to many forms of familial AD. Aluminium is reported to play a key role in inducing conformational change in the synthetic beta-amyloid peptide (1-40)from alpha-helix to beta-pleated sheet, leading to aggregation and fibrillar formation. We have studied the interaction of amino acid-Al complexes such as D-Asp-Al and L-Glu-Al with A beta(1-40) in TFE/buffer (70% TFE and 30% H2O v/v pH 6.7) mixture using CD spectroscopy. The interaction of either of these amino acid complexes with A beta(1-40) results in loss of alpha-helical content and the peptide is more unstructured compared to free Al3+ in the solution. Our data strongly support the idea, that the Al3+ in the form of aminoacid-Al complexes is more effective in inducing random coil conformation in the A beta peptide than the free Al3+ present in the solution.

Withania somnifera reverses Alzheimer's disease pathology by enhancing low-density lipoprotein receptor-related protein in liver

A 30-d course of oral administration of a semipurified extract of the root of Withania somnifera consisting predominantly of withanolides and withanosides reversed behavioral deficits, plaque pathology, accumulation of beta-amyloid peptides (A beta) and oligomers in the brains of middle-aged and old APP/PS1 Alzheimer's disease transgenic mice. It was similarly effective in reversing behavioral deficits and plaque load in APPSwInd mice (line J20). The temporal sequence involved an increase in plasma A beta and a decrease in brain A beta monomer after 7 d, indicating increased transport of A beta from the brain to the periphery. Enhanced expression of low-density lipoprotein receptor-related protein (LRP) in brain microvessels and the A beta-degrading protease neprilysin (NEP) occurred 14-21 d after a substantial decrease in brain A beta levels. However, significant increase in liver LRP and NEP occurred much earlier, at 7 d, and were accompanied by a rise in plasma sLRP, a peripheral sink for brain A beta. In WT mice, the extract induced liver, but not brain, LRP and NEP and decreased plasma and brain A beta, indicating that increase in liver LRP and sLRP occurring independent of A beta concentration could result in clearance of A beta. Selective down-regulation of liver LRP, but not NEP, abrogated the therapeutic effects of the extract. The remarkable therapeutic effect of W. somnifera mediated through up-regulation of liver LRP indicates that targeting the periphery offers a unique mechanism for A beta clearance and reverses the behavioral deficits and pathology seen in Alzheimer's disease models.

Estudio de la prevalencia de la enfermedad de estomatitis vesicular en animales de pezuña hendida en fincas con casos positivos en Nicaragua en el año 2008

Debido a su gran poder de difusión y considerando que no hay programa de erradicación o control de la estomatitis vesicular, aunque los humanos también la puede contraer, se llevo a cabo el presente estudio, con el objetivo de conocer la prevalencia de la Estomatitis Vesicular en el territorio nacional en el año 2008, así como los departamentos de mayor prevalencia, sexo, especie, serotipo de mayor concurrencia y regiones anatómicas afectadas, los datos colectados se obtuvieron de las base de datos del MAGFOR de Enfermedades Vesiculares que lleva la oficina del Convenio Bilateral Antiaftosa (CAB), se utilizo la información de los casos atendidos en el año 2008, se llevó un análisis estadístico descriptivo, elaborando distribuciones de frecuencia, para las variables; prevalencia, especie animal, región anatómica, cepa y sexo concluyendo que de una población total de 71592 animales susceptible, 1813 animales salieron afectados con una prevalencia de 3%, siendo Estelí el departamento mayor afectado con 7% y la RAAN la menor con 0%, manifestándose con mayor frecuencia en los llamados veranillos, los cuales son periodos secos durante la época lluviosa haciendo que hallan mayor agrietamiento en la pesuñas permitiéndole entrada a la penetración del virus provocando mayor afectación en la región podal con 76.7%, el serotipo New jersey esta afectando en un 97.36% . y el Indiana con 2.64%.

Estatuto antropológico de la enfermedad y el dolor en el enfermo terminal

Resumen: Los conceptos de dolor, enfermedad y enfermedad terminal exceden plenamente el ámbito meramente biológico y solo pueden abordarse acabadamente desde una perspectiva hilemorfista de persona humana. El enfoque integral de estos conceptos permite descubrir un significado antropológico de los mismos. Su comprensión adecuada constituye un imperativo moral en el cuidado del paciente terminal. En este sentido, es posible rescatar el valor de los cuidados paliativos como una modalidad de atención integral del paciente. En este contexto surge el proyecto de la Casa de la Bondad Salta, que pertenece a la Fundación Manos Abiertas. La Casa de la Bondad tiene como objetivo implementar cuidados paliativos a enfermos terminales. Se parte de la necesidad de realizar un abordaje integral del enfermo desde un enfoque transdisciplinar.

Efectos marco : el problema de la enfermedad de Asia en una muestra de estudiantes argentinos

Resumen: El efecto marco de riesgo constituye un ejemplo de irracionalidad en la toma de decisiones. Se trata de las variaciones en las respuestas inducidas por el marco positivo o negativo en el que una tarea es presentada. El problema de la enfermedad de Asia, Tversky y Kahneman (1981), es una de las tareas diseñadas para evaluar este fenómeno. En el presente estudio se resumen los resultados de investigaciones previas respecto de este efecto y su relación con una serie de factores. Luego se exponen los resultados obtenidos en una muestra de 163 estudiantes universitarios argentinos. Estos resultados indican tanto en hombres como en mujeres, el efecto marco surge únicamente cuando la tarea es presentada negativamente: bajo esta condición los participantes tienden a elegir la opción riesgosa.

La comunicación de la verdad global a la persona con una enfermedad incurable: qué, cómo y por qué decirlo

Resumen: El encuentro de salud se da entre un ser humano doliente, que busca ayuda, y otro con capacidad técnica, que está en disposición de prestársela. La calidad de la comunicación influye en el paciente afectando la mejor comprensión de los problemas, en la adherencia terapéutica y en los resultados. Finalmente, es una herramienta básica para expresar en la práctica asistencial la información global al paciente, adaptando los conocimientos sanitarios a las características y contexto de cada uno. En la relación asistencial es tanto o más importante que lo que se dice el modo y la ocasión en que se dice. Sólo de esta forma el profesional de la salud estará preparado para comunicar una verdad global.

Age-dependent decrease in glutamine synthetase expression in the hippocampal astroglia of the triple transgenic Alzheimer's disease mouse model : mechanism for deficient glutamatergic transmission?

Astrocytes are fundamental for brain homeostasis and the progression and outcome of many neuropathologies including Alzheimer's disease (AD). In the triple transgenic mouse model of AD (3xTg-AD) generalised hippocampal astroglia atrophy precedes a restricted and specific beta-amyloid (A beta) plaque-related astrogliosis. Astrocytes are critical for CNS glutamatergic transmission being the principal elements of glutamate homeostasis through maintaining its synthesis, uptake and turnover via glutamate-glutamine shuttle. Glutamine synthetase (GS), which is specifically expressed in astrocytes, forms glutamine by an ATP-dependent amination of glutamate. Here, we report changes in GS astrocytic expression in two major cognitive areas of the hippocampus (the dentate gyrus, DG and the CA1) in 3xTg-AD animals aged between 9 and 18 months. We found a significant reduction in Nv (number of cell/mm(3)) of GS immunoreactive (GS-IR) astrocytes starting from 12 months (28.59%) of age in the DG, and sustained at 18 months (31.65%). CA1 decrease of GS-positive astrocytes Nv (33.26%) occurs at 18 months. This Nv reduction of GSIR astrocytes is paralleled by a decrease in overall GS expression (determined by its optical density) that becomes significant at 18 months (21.61% and 19.68% in DG and CA1, respectively). GS-IR Nv changes are directly associated with the presence of A beta deposits showing a decrease of 47.92% as opposed to 23.47% in areas free of A beta. These changes in GS containing astrocytes and GS-immunoreactivity indicate AD-related impairments of glutamate homeostatic system, at the advanced and late stages of the disease, which may affect the efficacy of glutamatergic transmission in the diseased brain that may contribute to the cognitive deficiency.

GFAP Isoforms in Adult Mouse Brain with a Focus on Neurogenic Astrocytes and Reactive Astrogliosis in Mouse Models of Alzheimer Disease

24 p.

La enfermedad tuberculosa en Bilbao al inicio del siglo XXI (1993-2002)

La Tuberculosis es una enfermedad cuya presencia ha sido constante en la historia de la humanidad. Como toda enfermedad infectocontagiosa no respeta fronteras, ni edades, ni sexos, ni razas, ni tampoco clases sociales. La tuberculosis que actualmente padecemos no es nueva; representa el final de una onda epidémica secular que alcanzó su máxima incidencia en Europa entre 1780 y 1880. Cien años marcados por el desplazamiento masivo de campesinos a las ciudades en busca de trabajo en las fábricas. Históricamente la epidemiología de la tuberculosis ha demostrado la existencia de un declive natural. Dicho declive se inició ya, incluso antes del descubrimiento de su agente causal, debido a la mejoría de las condiciones socio-económicas de la población. La aparición de la quimioterapia específica aceleró su ritmo de descenso anual. Hasta la aparición del SIDA, ningún otro factor ha modificado substancialmente su natural declinar. Tan importante son las condiciones socioeconómicas y sociopolíticas de la población en la expresión epidemiológica de ésta y otras muchas enfermedades, que en 1910, cuando no existían remedios para la tuberculosis, Holanda alcanzó el llamado punto de ruptura. Dicho punto es aquel en que se considera que la tuberculosis camina hacia su erradicación espontánea. Corresponde al momento en que cada enfermo bacilífero no puede infectar al número suficiente de personas para que se origine otro nuevo enfermo bacilífero. Evidentemente el SIDA ha supuesto una inyección de gasolina en la llama de la enfermedad tuberculosa que ha desbaratado los programas de prevención y control puestos en marcha en 1982 en nuestra Comunidad Autónoma. Como decía Napoleón Bonaparte, las batallas se ganan con organización y dinero. La batalla del SIDA aún continúa y con más ahínco en nuestro País Vasco donde esta enfermedad es especialmente prevalente. Afortunadamente los nuevos tratamientos han convertido una enfermedad mortal de necesidad en una enfermedad crónica con una mejora substancial en las expectativas de vida. Sin embargo, la gran secuela de la coinfección SIDA/Tuberculosis ha sido la aparición de multirresistencias a los fármacos por tratamientos incorrectos o falta de adherencia del paciente a los mismos. Parece que el devenir de la tuberculosis, al margen de los factores políticos, culturales y económicos, ligados a la globalización y al desarrollo sostenible dentro de un modelo neoliberal; de los movimientos de masas: inmigrantes y refugiados; del racismo; de las desigualdades de género; de la diferente accesibilidad, cobertura y eficacia en los Sistemas Públicos de Salud, etc., al margen de todo esto, la tuberculosis va a quedar condicionada a cuatro factores de índole biomédica: a) A la evolución de las multirresistencias. b) A la subordinación con la coinfección VIH. c) Al establecimiento de los denominados "nichos ecológicos", en donde la enfermedad alcanzará su máxima progresión (mayores de 65 años, sobre todo los de bajo nivel económico; inmigrantes procedentes de zonas de endemia elevada; personal sanitario y trabajadores expuestos; colectivos con adicción a drogas por vía parenteral (ADVP); alcohólicos; personas con padecimientos crónicos; pacientes en tratamientos prolongados con corticoides e inmunosupresores). En estos nichos ecológicos es donde hay que mantener un elevado índice de sospecha y establecer las estrategias adecuadas para la detección precoz de la enfermedad. d) Al éxito que se obtenga con la nueva vacuna terapéutica contra la TB creada por Joan Pere Cardona. La epidemiología de la tuberculosis estará próximamente ligada a la biología molecular y a la genética. En efecto, ya no bastará con identificar al bacilo de Koch en un paciente. Será imprescindible saber qué cepas están actuando en una determinada colectividad, así como su grado de sensibilidad frente a los tuberculostáticos. Acabó el siglo XX, hemos iniciado la segunda década del siglo XXI y la pelota aún sigue en el tejado. Estamos ante un problema de primera magnitud que hace mucho tiempo que dejó de seducir a los románticos. Como señala Bignall, comparando a la tuberculosis con lo que en su día supuso la viruela como problema de Salud Pública: La viruela se erradicó porque no sólo se disponía de una vacuna eficaz, sino además porque no requería habilidad en las relaciones humanas. Sin embargo, en la tuberculosis, la lucha ya no es contra el bacilo sino contra la mentalidad y las miserias humanas; por ello será larga, muy larga. Por todo esto y visto lo previamente descrito concluimos: 1. En la década 1993 a 2002 se diagnosticaron 847 casos de tuberculosis, 548 varones y 299 mujeres; 364 con SIDA y 483 sin demostración de VIH. 2. Si agrupamos las características medias de todos los casos recogidos, definiríamos al paciente tipo como a un varón con serología VIH negativa, una edad de 46,6 años y una afección tuberculosa de localización extrapulmonar, atendida en el Servicio de Enfermedades Infecciosas del Hospital. 3. Si el paciente tuberculoso que escogiéramos tuviera 31 años, la edad con más casos acumulados de la serie, al igual que los de 30 y 32 años, lo más frecuente que observaríamos, sería un paciente varón con SIDA y adicción a drogas por vía parenteral. 4. Aunque el sexo predominante es el varón entre los enfermos de tuberculosis, este predominio se atenúa al prescindir de los pacientes que asociaron SIDA. 5. El principal factor de riesgo para contraer el VIH en los tísicos con SIDA fue la ADVP. 6. El número de casos totales anuales viene descendiendo desde 1991, fundamentalmente a expensas del declive entre los casos que asociaron SIDA. 7. Es necesario disminuir el tiempo de demora 2 consistente en el número de días que transcurren desde que el paciente manifiesta sus primeros síntomas hasta que éste recibe el tratamiento. Puesto que el tiempo de demora 1 (que va desde que el paciente es visto en el hospital hasta que se instaura el tratamiento) cumple con los objetivos marcados en el Programa de control y prevención del Gobierno Vasco, deducimos que la Atención Primaria tiene la máxima importancia en acelerar este acortamiento del tiempo de demora disminuyendo así el periodo de riesgo de transmisión de la enfermedad. 8. La tuberculosis es una enfermedad que tiende a su natural declinar pero haciéndolo muy lentamente. Actualmente, la encontramos en zonas periféricas de la ciudad donde el VIH hace estragos en pacientes jóvenes con estilos de vida nada saludables. A estas zonas deprimidas se las denominan "nichos ecológicos". 9. La lucha contra esta enfermedad deberá ser enfocada hacia estos "nichos ecológicos". La condición necesaria para que consigamos acelerar la eliminación de la enfermedad consistirá en que diagnostiquemos y tratemos los casos afectados junto a la búsqueda de sus contactos. Pero en la tuberculosis, esto no es suficiente. Estamos luchando frente a un bacilo que se aprovecha de los más débiles, los inmunodeprimidos, edades extremas de la vida, drogodependientes, alcohólicos, zonas deprimidas económica y socialmente, que podemos delimitar en un plano y concentrar en él las medidas de control pertinentes. No olvidemos que estamos frente a un bacilo que se enclaustra en una caverna, que infecta a la tercera parte de la humanidad y espera. La tuberculosis desaparecerá en la medida en que la sociedad prospere.

Preprocess and data analysis techniques for affymetrix DNA microarrays using bioconductor: a case study in Alzheimer disease

DNA microarray, or DNA chip, is a technology that allows us to obtain the expression level of many genes in a single experiment. The fact that numerical expression values can be easily obtained gives us the possibility to use multiple statistical techniques of data analysis. In this project microarray data is obtained from Gene Expression Omnibus, the repository of National Center for Biotechnology Information (NCBI). Then, the noise is removed and data is normalized, also we use hypothesis tests to find the most relevant genes that may be involved in a disease and use machine learning methods like KNN, Random Forest or Kmeans. For performing the analysis we use Bioconductor, packages in R for the analysis of biological data, and we conduct a case study in Alzheimer disease. The complete code can be found in https://github.com/alberto-poncelas/ bioc-alzheimer