Structural Integrity of the Greek Key Motif in beta gamma-Crystallins Is Vital for Central Eye Lens Transparency

Background: We highlight an unrecognized physiological role for the Greek key motif, an evolutionarily conserved super-secondary structural topology of the beta gamma-crystallins. These proteins constitute the bulk of the human eye lens, packed at very high concentrations in a compact, globular, short-range order, generating transparency. Congenital cataract (affecting 400,000 newborns yearly worldwide), associated with 54 mutations in beta gamma-crystallins, occurs in two major phenotypes nuclear cataract, which blocks the central visual axis, hampering the development of the growing eye and demanding earliest intervention, and the milder peripheral progressive cataract where surgery can wait. In order to understand this phenotypic dichotomy at the molecular level, we have studied the structural and aggregation features of representative mutations. Methods: Wild type and several representative mutant proteins were cloned, expressed and purified and their secondary and tertiary structural details, as well as structural stability, were compared in solution, using spectroscopy. Their tendencies to aggregate in vitro and in cellulo were also compared. In addition, we analyzed their structural differences by molecular modeling in silico. Results: Based on their properties, mutants are seen to fall into two classes. Mutants A36P, L45PL54P, R140X, and G165fs display lowered solubility and structural stability, expose several buried residues to the surface, aggregate in vitro and in cellulo, and disturb/distort the Greek key motif. And they are associated with nuclear cataract. In contrast, mutants P24T and R77S, associated with peripheral cataract, behave quite similar to the wild type molecule, and do not affect the Greek key topology. Conclusion: When a mutation distorts even one of the four Greek key motifs, the protein readily self-aggregates and precipitates, consistent with the phenotype of nuclear cataract, while mutations not affecting the motif display `native state aggregation', leading to peripheral cataract, thus offering a protein structural rationale for the cataract phenotypic dichotomy ``distort motif, lose central vision''.

Dissecting Ubiquitin Folding Using the Self-Organized Polymer Model

Folding of Ubiquitin (Ub), a functionally important protein found in eukaryotic organisms, is investigated at low and neutral pH at different temperatures using simulations of the coarse-grained self-organized-polymer model with side chains (SOP-SC). The melting temperatures (T-m's), identified with the peaks in the heat capacity curves, decrease as pH decreases, in qualitative agreement with experiments. The calculated radius of gyration, showing dramatic variations with pH, is in excellent agreement with scattering experiments. At T-m Ub folds in a two-state manner at low and neutral pH. Clustering analysis of the conformations sampled in equilibrium folding trajectories at T-m with multiple transitions between the folded and unfolded states, shows a network of metastable states connecting the native and unfolded states. At low and neutral pH, Ub folds with high probability through a preferred set of conformations resulting in a pH-dependent dominant folding pathway. Folding kinetics reveal that Ub assembly at low pH occurs by multiple pathways involving a combination of nucleation-collapse and diffusion collision mechanism. The mechanism by which Ub folds is dictated by the stability of the key secondary structural elements responsible for establishing long-range contacts and collapse of Ub. Nucleation collapse mechanism holds if the stability of these elements are marginal, as would be the case at elevated temperatures. If the lifetimes associated with these structured microdomains are on the order of hundreds of microseconds, then Ub folding follows the diffusion collision mechanism with intermediates, many of which coincide with those found in equilibrium. Folding at neutral pH is a sequential process with a populated intermediate resembling that sampled at equilibrium. The transition state structures, obtained using a P-fold analysis, are homogeneous and globular with most of the secondary and tertiary structures being native-like. Many of our findings for both the thermodynamics and kinetics of folding are not only in agreement with experiments but also provide missing details not resolvable in standard experiments. The key prediction that folding mechanism varies dramatically with pH is amenable to experimental tests.

Biodegradação dos óleos e sua relação com as fácies sedimentares da região do Anhembi

Este trabalho consistiu em aprimorar o entendimento da rota de migração do óleo no reservatório e verificar a possibilidade de variação da intensidade da biodegradação com as heterogeneidades existentes. Foram utilizadas como base para a dissertação sete amostras coletadas na bacia sedimentar do Paraná, no arenito asfáltico do Anhembi, afloramento da Fazenda Betumita. A Fazenda Betumita é considerada a ocorrência mais expressiva de óleo na região do alto estrutural do Anhembi, apresentando a maior acumulação de arenito asfáltico na borda leste da Bacia do Paraná. A ocorrência dos arenitos asfálticos na área de estudo é predominantemente por arenitos da Formação Pirambóia. Estes arenitos foram preenchidos por hidrocarbonetos relacionados ao sistema Irati-Pirambóia e são caracterizados como imaturo, devido ausência de n-alcanos e abundância de esteranos e terpanos. As amostras coletadas foram analisadas através da cromatografia líquida e gasosa e correlacionadas com a descrição das fácies do afloramento. A biodegradação do óleo apresentou a tendência de aumentar do topo para a base do afloramento, local caracterizado por fácies subaquosas, onde se encontra o contato óleo/água, propício para o crescimento dos microorganismos degradadoras de óleo. Na fácie de interduna, a biodegradação foi menor, pois este ambiente é caracterizado por partículas argilo-minerais e menores permo-porosidade, não propício para o crescimento de microorganismos capazes de degradar o óleo. Foi observada a presença de diasteranos e 25-norhopanos nas amostras coletadas, indicando que o óleo do afloramento está severamente biodegradado. Os esteranos apresentaram maior biodegradação na base do afloramento onde está o contato óleo/água e maior reposição de oxigênio pela infiltração de água meteórica, tornando-se ambiente propício para crescimento das bactérias aeróbicas tendendo a degradar preferencialmente os esteranos. Entretanto os hopanos apresentaram maior biodegradação no topo do afloramento, local com condições propícias para o crescimento das bactérias anaeróbicas, que tenderam a degradar preferencialmente os hopanos. As informações adquiridas nesta pesquisa são de grande relevância para o conhecimento na exploração do petróleo, pois geralmente esses conhecimentos não estão disponíveis nos dados de subsuperfície. Este trabalho servirá de parâmetro para o planejamento da produção e recuperação secundária e terciária de reservatórios com fácies sedimentares semelhantes da área estudada.

Prevalência de sintomas depressivos em uma população de idosos usuários de serviços públicos

Esta dissertação pretende estimar a prevalência de sintomas depressivos em idosos segundo três níveis de complexidade de atenção à saúde e estudar a co-ocorrência de sintomas depressivos e incapacidade funcional. No Brasil, a transição demográfica ocorreu de forma rápida e explosiva. À medida que o número de idosos cresce ocorre o aumento da prevalência de doenças crônicas e suas complicações. A habilidade funcional pode ser vista como uma medida de resumo do impacto geral das condições médicas no contexto do ambiente e do sistema de apoio social do indivíduo, e deve ser uma consideração importante em qualquer planejamento de saúde. Uma enfermidade associada a elevado grau de incapacidade funcional é a depressão. Entre os agravos de saúde mental, a depressão é um dos mais comuns e importantes problemas psiquiátricos entre indivíduos idosos. Trata-se de estudo transversal com tamanho amostral de 643 idosos com idade de 65 ou mais anos selecionados aleatoriamente e usuários de três serviços públicos de saúde com níveis crescentes de complexidade (primário, secundário e terciário). A prevalência de sintomas depressivos foi estimada a partir da EDG-15, já traduzida e validada para uso no Brasil. O nível de estado funcional foi definido conforme os escores dos instrumentos SF-36 e HAQ. A prevalência de sintomas depressivos na amostra total foi de 45,2% (IC=41,1 49,3). Estratificando por unidade, a prevalência foi de 35,3% no nível primário, 47,6% no nível secundário e 51,7% no nível terciário (p=0,004). As prevalências encontradas foram altas nos três níveis de complexidade de atendimento, inclusive na população de idosos da unidade básica de saúde, apesar de serem idosos mais independentes e mais saudáveis. A prevalência geral de sintomas depressivos aumentou à medida que o grau de incapacidade funcional também aumentou. A busca ativa por idosos com sintomas depressivos é importante em todos os níveis de complexidade de atendimento do sistema de saúde.

Avaliação de indicadores e áreas selecionadas de expansão da estratégia saúde da família na cidade do Rio de Janeiro

A Estratégia Saúde da Família na Cidade do Rio de Janeiro não pode ser pensada como um instrumento isolado no contexto de saúde local. A sua interação com a rede de saúde da cidade precisa ser considerada para que ocorra um fluxo de pacientes entre os níveis de atenção. O Rio de Janeiro é dividido em dez Áreas Programáticas com coordenações de saúde próprias. O tamanho e a diversidade das regiões da cidade do Rio de Janeiro faz com que estas áreas tenham necessidades particulares e, consequentemente exijam respostas diferenciadas para as questões de saúde. A área em foco neste estudo é a 3.1 onde se localiza o Complexo do Alemão. O Complexo é marcado pela pobreza, violência e exclusão social. No ano 2000 tinha o Índice Desenvolvimento Humano (IDH) de 0,474, um dos piores entre os bairros do Rio de Janeiro. O cenário de vulnerabilidade foi determinante para que o Complexo fosse uma das primeiras áreas a ter intervenções do Programa de Agentes Comunitários de Saúde e do Programa Saúde da Família na cidade do Rio de Janeiro. Este estudo procura relacionar as características da Estratégia Saúde da Família na Cidade do Rio de Janeiro com as características do modelo implantado no Complexo do Alemão, a partir de dados dos sistemas de informação e de busca bibliográfica sobre a região. Há características que são comuns ao Rio de Janeiro e ao Complexo do Alemão, como por exemplo, a falta de uma programação de referência e contra-referência para atender a demanda dos pacientes da Estratégia Saúde da Família nos níveis secundário e terciário de cuidados. Existem também características que são próprias do Complexo do Alemão, como por exemplo, a quantidade de equipes compatível com a população segundo as diretrizes do Ministério da Saúde, o que contrasta com a cidade como um todo que tem uma quantidade de equipes ainda pequena em relação à população.

Análise da variabilidade gênica de antígenos de T. cruzi com aplicação para o diagnóstico sorológico da doença de Chagas

A doença de Chagas é uma zoonose causada pelo protozoário flagelado Trypanosoma cruzi. Estima-se que 8 milhões de pessoas estão infectadas com o T. cruzi em todo o mundo, principalmente na América Latina. Testes tradicionais de diagnóstico estão sendo gradualmente substituídos por métodos inovadores. A utilização de antígenos recombinantes foi proposta nos anos 90, e várias combinações foram testadas com soros de pacientes com diferentes formas clínicas de diferentes regiões da América Latina. Apesar do ganho em especificidade, estes testes apresentaram menor sensibilidade, frustrando expectativas. Este estudo objetivou analisar a variabilidade genética dos genes KMP11 e 1F8 que codificam antígenos comumente utilizados em diagnóstico experimental. Cepas de T. cruzi pertencentes a diferentes sub-grupos taxonômicos e de diferentes regiões foram analisadas para avaliar o impacto da variação antigênica em testes de diagnóstico. Maximizando a sensibilidade, evitar reatividade cruzada com epítopos de outros agentes patogênicos deve permitir a concepção de melhores testes rápidos. Num primeiro passo, DNA genômico foi extraído das seguintes cepas: Dm28c, Colombiana, Y, 3663, 4167, LL014 e CL Brener e foi realizada a amplificação dos genes 1F8 e KMP11 que codificam antígenos a partir destas cepas. Em seguida foram realizadas a clonagem, sequenciamento, expressão e detecção dos antígenos recombinantes. Na etapa final, análises de estruturas secundárias e terciárias, a última apenas para o antígeno 1F8, visualizaram as diferenças nas sequências de aminoácidos obtidas a partir de sequenciamento de DNA. Os resultados apresentados neste estudo mostram que o antígeno KMP11 de T. cruzi possui uma similaridade na sequência de aminoácidos muito elevada com o T. rangeli, mostrando a necessidade de um mapeamento antigênico desta proteína em todos os tripanosomatídeos que apresentaram alta similaridade com o antígeno de T. cruzi, como o T. rangeli, para verificar a presença de epítopos específicos de T. cruzi. O antígeno 1F8 pode ser uma ferramenta útil no diagnóstico da doença de Chagas e que será necessário aprofundar os conhecimentos sobre os determinantes antigênicos para futuramente elaborar poli-epítopos sintéticos adaptados de um maior número possível de antígenos, obtendo a maior especificidade e sensibilidade nos testes de diagnóstico sorológico e de teste rápido da doença de Chagas. Este estudo representa um passo crucial para a otimização de antígenos recombinantes para o diagnóstico da doença de Chagas.

路易斯碱催化还原胺化反应研究

胺及其衍生物是很多重要生物活性分子的结构单元，是合成天然产物和手性药物的重要中间体。 直接还原胺化由于其合成步骤简单而成为制备二级胺和三级胺的简便方法。为了发展一种较为简便的直接还原胺化反应，我们把研究的重点放在开发一种简便实用的有机小分子催化方法上。由文献调研可知，现已报道的直接还原胺化方法大多是催化醛或酮与一级胺或者脂肪二级胺的直接还原胺化，而醛或酮与芳香二级胺的直接还原胺化却尚无报道。在本文中，我们发现用简单的四甲基乙二胺(TEMED)在室温下以二氯甲烷为溶剂即可催化三氯氢硅对酮和芳香二级胺之间的直接还原胺化反应，并取得了高达92%的收率。该反应条件温和，底物普适性广，各种类型的酮均可以与芳香二级胺进行直接还原胺化，并且得到比较满意的收率。 同时，我们从手性Sulfoximine出发，设计和合成了一系列的Sulfoximine类新衍生物，并将其应用于间接还原胺化反应中。遗憾的是我们并没有得到预期的不对称催化效果。 Amines and their derivatives are basic structural motifs in natural products and pharmaceuticals and highly versatile building blocks for various organic substrates. Direct reductive amination (DRA) is a convenient method for the preparation of secondary and tertiary amines owing to its operational simplicity. In an effort to develop a simple and convenient procedure for direct reductive amination reaction, we focused our study on search for a mild and efficient organocatalytic system. In the literature, there are many reports concerning DRA between aldehydes or ketones and either primary amines or secondary aliphatic amines. But there are no reports concerning DRA between aldehydes or ketones and secondary aromatic amines. In this study, we have developed a highly practical method for the synthesis of tertiary amines by the direct reductive amination of ketones and secondary aromatic amines with tetramethylethylenediamine (TEMED) as the catalyst using HSiCl3 as the reducing agent in dichloromethane (affording up to 92% yield). This method can be carried out under mild conditions and is compatible with many functional groups. A variety of ketones were efficiently aminated with secondary aromatic amines to afford the corresponding amines in good to excellent yields. Starting from chiral sulfoximine, we designed and synthesized a series of new sulfoximine derivatives and tested their efficiencies as asymmetric organocatalysts for the reduction of imines, which, unfortunately, only exhibited low catalytic activity and enantioselectivity.

Structural electrochemical study of hemoglobin by in situ circular dichroism thin layer spectroelectrochemistry

Secondary and tertiary or quaternary structural changes in hemoglobin (HB) during an electroreduction process were studied by in situ circular dichroism (CD) spectroelectrochemistry with a long optical path thin-layer cell. By means of singular value decomposition least-squares analysis, CD spectra in the far-UV region give two similar a components with different CD intensity, indicating slight denaturation in the secondary structures due to the electric field effect. CD spectra in the Soret band show a R --> T transition of two quaternary structural components induced by electroreduction of the heme, which changes the redox states of the center ion from Fe3+ to Fe2+ and the coordination number from 6 to 5. The double logarithmic analysis shows that electroreduction of hemoglobin follows a chemical reaction with R --> T transition. Some parameters in the electrochemical process were obtained: formal potential, E-0t = -0.167 V; electrochemical kinetic overpotential, DeltaE(0) = -0.32 V; standard electrochemical reaction rate constant, k(0) = 1.79 x 10(-5) cm s(-1); product of electron transfer coefficient and electron number, alphan=0.14; and the equilibrium constant of R --> T transition, K-c = 9.0.

Genome-wide association study of perioperative myocardial infarction after coronary artery bypass surgery.

OBJECTIVES: Identification of patient subpopulations susceptible to develop myocardial infarction (MI) or, conversely, those displaying either intrinsic cardioprotective phenotypes or highly responsive to protective interventions remain high-priority knowledge gaps. We sought to identify novel common genetic variants associated with perioperative MI in patients undergoing coronary artery bypass grafting using genome-wide association methodology. SETTING: 107 secondary and tertiary cardiac surgery centres across the USA. PARTICIPANTS: We conducted a stage I genome-wide association study (GWAS) in 1433 ethnically diverse patients of both genders (112 cases/1321 controls) from the Genetics of Myocardial Adverse Outcomes and Graft Failure (GeneMAGIC) study, and a stage II analysis in an expanded population of 2055 patients (225 cases/1830 controls) combined from the GeneMAGIC and Duke Perioperative Genetics and Safety Outcomes (PEGASUS) studies. Patients undergoing primary non-emergent coronary bypass grafting were included. PRIMARY AND SECONDARY OUTCOME MEASURES: The primary outcome variable was perioperative MI, defined as creatine kinase MB isoenzyme (CK-MB) values ≥10× upper limit of normal during the first postoperative day, and not attributable to preoperative MI. Secondary outcomes included postoperative CK-MB as a quantitative trait, or a dichotomised phenotype based on extreme quartiles of the CK-MB distribution. RESULTS: Following quality control and adjustment for clinical covariates, we identified 521 single nucleotide polymorphisms in the stage I GWAS analysis. Among these, 8 common variants in 3 genes or intergenic regions met p<10(-5) in stage II. A secondary analysis using CK-MB as a quantitative trait (minimum p=1.26×10(-3) for rs609418), or a dichotomised phenotype based on extreme CK-MB values (minimum p=7.72×10(-6) for rs4834703) supported these findings. Pathway analysis revealed that genes harbouring top-scoring variants cluster in pathways of biological relevance to extracellular matrix remodelling, endoplasmic reticulum-to-Golgi transport and inflammation. CONCLUSIONS: Using a two-stage GWAS and pathway analysis, we identified and prioritised several potential susceptibility loci for perioperative MI.

Trophic amplification of climate warming

Ecosystems can alternate suddenly between contrasting persistent states due to internal processes or external drivers. It is important to understand the mechanisms by which these shifts occur, especially in exploited ecosystems. There have been several abrupt marine ecosystem shifts attributed either to fishing, recent climate change or a combination of these two drivers. We show that temperature has been an important driver of the trophodynamics of the North Sea, a heavily fished marine ecosystem, for nearly 50 years and that a recent pronounced change in temperature established a new ecosystem dynamic regime through a series of internal mechanisms. Using an end-to-end ecosystem approach that included primary producers, primary, secondary and tertiary consumers, and detritivores, we found that temperature modified the relationships among species through nonlinearities in the ecosystem involving ecological thresholds and trophic amplifications. Trophic amplification provides an alternative mechanism to positive feedback to drive an ecosystem towards a new dynamic regime, which in this case favours jellyfish in the plankton and decapods and detritivores in the benthos. Although overfishing is often held responsible for marine ecosystem degeneration, temperature can clearly bring about similar effects. Our results are relevant to ecosystem-based fisheries management (EBFM), seen as the way forward to manage exploited marine ecosystems.

Prevenção do tabagismo: um caminho na prestação de cuidados de saúde

Esta tese é constituída por dois estudos. O estudo de prevenção primária é experimental, ensaio clínico randomizado, cujo programa de intervenção “Para- Par sem Tabaco” é baseado na metodologia da formação pelos pares, com o objectivo de avaliar a sua eficácia. A amostra é constituída por 310 estudantes que frequentam o 7º e 8º Anos das Escolas Básicas e Secundárias de Oliveira de Azeméis por amostragem aleatória em conglomerados (turmas). 153 estudantes constituíram o grupo de controlo e 157 o grupo experimental. A observação foi feita antes, no final e passado um ano da intervenção. Foram construídas e validadas três escalas, que apresentaram bons argumentos de fidelidade e validade. Dos resultados ressaltam os benefícios na redução do consumo de cigarros por semana, a perspectiva futura menos associada ao consumo de tabaco; uma evolução na concordância sobre o alto risco face à auto-estima, comportamentos e tabaco; e alguma consistência nas suas percepções sobre o tabaco e as motivações dos fumadores. Verificou-se uma maior eficácia no sexo masculino. Nos dois grupos, com o aumento da idade, aumentou a idade de experimentação tabágica, o número de cigarros consumidos semanalmente e o número de amigos fumadores. No grupo experimental, constata-se que os adolescentes filhos de pais fumadores consomem mais cigarros por semana e têm mais amigos fumadores. O estudo de prevenção secundária e terciária do tabagismo foi efectuado com o objectivo de avaliar a eficácia e identificar os factores que interferem nas consultas de cessação tabágica. Tratando-se de um estudo descritivocorrelacional retrospectivo e de coorte. A amostra (probabilística aleatória – K=4) foi constituída por 395 elementos inscritos na consulta de cessação tabágica de 12 Centros de Saúde do Distrito de Aveiro entre 2004 a 2009 (pesquisa de arquivo). A avaliação foi feita em três momentos: na última consulta, aos três e seis meses de seguimento. Conclui-se que os elementos com mais habilitações académicas, que consomem menos cigarros e com menor grau de dependência tabágica, são os que apresentam maior sucesso na cessação tabágica aos três meses de seguimento. Os sujeitos que referem, na primeira consulta, conseguir reduzir menos cigarros e os que apresentam maior motivação, na primeira consulta, são os que apresentam mais sucesso na cessação tabágica na última consulta e aos três meses de seguimento. Os elementos com mais idade, sem apoio familiar, que apresentam um maior tempo sem fumar, em tentativas anteriores e os que mais utilizaram as consultas, foram os que conseguiram mais sucesso na cessação tabágica aos três e seis meses de seguimento. Os elementos que não fizeram tratamento específico não têm sucesso. Os elementos da amostra obtiveram ganho ponderal com redução nos valores da pressão arterial sistólica e diastólica. Destes estudos foram retiradas algumas linhas orientadoras para a prestação de cuidados de saúde nesta complexa área de intervenção.

Lines in class The ongoing attack on mass education in England

Andrew McGettigan’s analysis of the financial transformations of higher education (‘Who Let the Dogs Out? The Privatization of Higher Education’, RP 174)is important for comprehending the complexity of the changes universities are undergoing and their implications. As he argues, ‘it is mass higher education in England’ that is now under attack and adequately responding to this requires the development of new habits and new forms of thought. It is also necessary to contextualize this attack in relation to comparable changes occurring in other educational sectors in England, not least because it is through control of the points of intersection between primary, secondary, and tertiary education that the government’s political intent is being most effectively realized. An analysis of these changes reveals the broader nature of the attack on the idea and practice of mass education itself.

Estimation de la mortalité évitable au Québec de 1981-1985 à 2005-2009

La progression de l’espérance de vie au Québec reflète l’amélioration de la santé de la population. Toutefois, des décès continuent à survenir prématurément avant l’âge de 75 ans. Une part de cette mortalité prématurée est potentiellement évitable. L'objectif de ce mémoire est d’estimer la mortalité évitable au Québec de 1981-1985 à 2005-2009. Pour cela, la méthode de Tobias et Jackson (2001) a été appliquée sur des données de décès, fournies par l’Institut national de santé publique du Québec, pour estimer les taux de mortalité évitable totale et pour chacun des sexes. Cette approche nous a, par ailleurs, permis d’estimer des taux de mortalité évitable selon trois paliers de prévention : primaire, secondaire et tertiaire. Nos résultats démontrent une tendance à la baisse de la mortalité évitable à travers le temps. Cette baisse a été enregistrée chez les deux sexes, mais des disparités de mortalité évitable existent entre les hommes et les femmes. En effet, la mortalité évitable des hommes est plus élevée que celle des femmes et cet écart de mortalité est principalement dû à la mortalité évitable associée à la prévention primaire. L’analyse de la mortalité évitable par cause de décès fait ressortir que le cancer du poumon est la principale cause de décès évitable tant chez les hommes que chez les femmes en 2005-2009. Durant cette même période, le cancer du sein et les cardiopathies ischémiques étaient la deuxième cause de décès évitable respectivement chez les femmes et chez les hommes.

Activation chimiosélective et dérivatisation d’amides et d'alcools : synthèse de plusieurs groupements fonctionnels et hétérocycles

Un objectif majeur en chimie organique est le développement de méthodes de synthèses générales, simples et peu coûteuses permettant la modification efficace des ressources naturelles en différents produits d’intérêt public. En particulier, la recherche de méthodes chimiosélectives et de méthodes dites « vertes » représente un intérêt croissant pour le secteur industriel (dont le domaine pharmaceutique). En fait, l’application en synthèse sur grande échelle de procédés catalytiques, sélectifs et utilisant des conditions douces permet de réduire le volume de déchets et la demande énergétique, minimisant ainsi les coûts de production et les effets néfastes sur l’environnement. Dans ce contexte, le groupe de recherche du Professeur André B. Charette de l’Université de Montréal s’intéresse au développement de méthodes générales et chimiosélectives permettant la transformation de fonctionnalités aisément accessibles tels que les amides et les alcools. La fonction amide, aussi appelée liaison peptidique dans les protéines, est présente dans diverses familles de molécules naturelles et est couramment employée comme intermédiaire synthétique dans la synthèse de produits d’intérêt pharmaceutique. Le groupement alcool est, quant à lui, l’une des fonctionnalités les plus abondantes dans la nature, intrinsèquement et largement utilisé en chimie de synthèse. Dans le cadre de cette thèse, des transformations simples, générales et chimiosélectives ont été réalisées sur des amides secondaires et tertiaires, ainsi que sur des alcools primaires et secondaires. La première partie de ce manuscrit se penche sur l’activation de la fonction amide par l’anhydride triflique (Tf2O), suivie de l’addition nucléophile de différents réactifs permettant ainsi la formation de plusieurs groupements fonctionnels versatiles, parfois indispensables, couramment employés en chimie organique tels que les aldimines, les aldéhydes, les amines, les cétones, les cétimines et des dérivés de la fonction amidrazone. Cette dernière fonctionnalité a également été utilisée dans des réactions successives vers la formation d’hétérocycles. De ce fait, des 1,2,4-triazoles ont été formés suite à une cyclodéshydratation initiée en conditions thermiques et faiblement acides. D’autre part, des 3-aminoindazoles ont été synthétisés par une fonctionnalisation C–H catalysée par un sel de palladium (II). La deuxième partie de la thèse est consacrée à la réaction de Mitsunobu en conditions acides, permettant ainsi la substitution nucléophile d’alcools en présence de carbamines (ou amines ne possédant pas de groupement électro-attracteurs). Ce type de nucléophile, basique lorsqu’utilisé comme base libre (avec un pKa se situant au-dessus de 13 dans le DMSO), n’est intrinsèquement pas compatible dans les conditions standards de la réaction de Mitsunobu. Contrairement aux conditions usuelles multi-étapes employant la réaction de Mitsunobu, la méthode développée au cours de cette étude permet la formation d’amines substituées en une seule étape et ne requiert pas l’emploi de groupements protecteurs.

Ecological characteristics of prawn culture fields in the Cochin area

Prawn culture by traditional method forms an important occupation for the people in these areas, especially in the Vypeen island. Though short term studies have been made on various aspects of prawn culture field and its ecology, a study of detailed nature covering perennial, seasonal, fields and canals between coconut plantation is lacking from these areas. This study will also enable to assess the relative productivity of different systems during different seasons and the influence of the environment on the production potentials. Therefore the present study is taken upto throw more light on the ecological characteristics of these fields with special emphasis on its primary, secondary and tertiary production. The present area of investigation includes the prawn culture fields adjacent to Cochin backwater. The Cochin backwater (O9° 58'N 76° 28'E) is a shallow semi-enclosed body of water of tropical estuary. A narrow gut, about 450 M wide forms its main connection with the Arabian sea and this region is subjected to regular tidal influenceertiary production.