Phosphoproteome analysis of mouse liver using immobilized metal affinity purification and linear ion trap mass spectrometry

Since protein phosphorylation is a dominant mechanism of information transfer in cells, there is a great need for methods capable of accurately elucidating sites of phosphorylation. In recent years mass spectrometry has become an increasingly viable alternative to more traditional methods of phosphorylation analysis. The present study used immobilized metal affinity chromatography (IMAC coupled with a linear ion trap mass spectrometer to analyze phosphorylated proteins in mouse liver. A total of 26 peptide sequences defining 26 sites of phosphorylation were determined. Although this number of identified phosphoproteins is not large, the approach is still of interest because a series of conservative criteria were adopted in data analysis. We note that, although the binding of non-phosphorylated peptides to the IMAC column was apparent, the improvements in high-speed scanning and quality of MS/MS spectra provided by the linear ion trap contributed to the phosphoprotein identification. Further analysis demonstrated that MS/MS/MS analysis was necessary to exclude the false-positive matches resulting from the MS/MS experiments, especially for multiphosphorylated peptides. The use of the linear ion trap considerably enabled exploitation of nanoflow-HPLC/MS/MS, and in addition MS/MS/MS has great potential in phosphoproteome research of relatively complex samples. Copyright (C) 2004 John Wiley Sons, Ltd.

PRINCIPLES FOR STRUCTURE GENERATION OF ORGANIC ISOMERS FROM MOLECULAR FORMULA

An expert system for the elucidation of the structure of organic compounds (ESESOC) has been developed. The heart of the ESESOC is formed by the structure generator as an integral part, which receives the specific type of information (molecular formula, s

Evaluating the quality of learning in Computer Supported Co-operative Learning

Can learning quality be maintained in the face of increasing class size by the use of Computer Supported Co-operative Learning (CSCL) technologies? In particular, can Computer-Mediated Communication promote critical thinking in addition to surface information transfer? We compared face-to-face seminars with asynchronous computer conferencing in the same Information Management class. From Garrison's theory of critical thinking and Henri's critical reasoning skills, we developed two ways of evaluating critical thinking: a student questionnaire and a content analysis technique. We found evidence for critical thinking in both situations, with some subtle differences in learning style. This paper provides an overview of this work.

An experiment in group learning technology: evaluating critical thinking in face-to-face and computer-supported seminars

Can learning quality be maintained in the face of increasing class size by the use of Computer Supported Co-operative Learning (CSCL) technologies? In particular, can Computer-Mediated Communication promote critical thinking in addition to surface information transfer? We compared face-to-face seminars with asynchronous computer conferencing in the same Information Management class. From Garrison's theory of critical thinking and Henri's critical reasoning skills, we developed two ways of evaluating critical thinking: a student questionnaire and a content analysis technique. We found evidence for critical thinking in both situations, with some subtle differences in learning style. This paper provides an overview of this work.

'Superluminal' tunnelling as a weak measurement effect

We exploit the analogy between the transfer of a pulse across a scattering medium and Aharonov's weak measurements to resolve the long standing paradox between the impossibility to exceed the speed of light and the seemingly "superluminal" behavior of a tunneling particle in the barrier or a photon in a "fast-light" medium. We demonstrate that superluminality occurs when the value of the duration tau spent in the barrier is uncertain, whereas when tau is known accurately, no superluminal behavior is observed. In all cases only subluminal durations contribute to the transmission which precludes faster-than-light information transfer, as observed in a recent experiment.

Data Reduction of Power System Disturbances using Wavelet Transforms for Network Operation and Control

Wavelet transforms provide basis functions for time-frequency analysis and have properties that are particularly useful for compression of analogue point on wave transient and disturbance power system signals. This paper evaluates the reduction properties of the wavelet transform using real power system data and discusses the application of the reduction method for information transfer in network communications.

New methodologies for directed functional connectivity applied to brain neuroimaging research

Tese de doutoramento, Engenharia Biomédica e Biofísica, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2015

Transfert et traitement de l’information visuomotrice dans le cerveau autiste : intégrité et hétérogénéité

En plus de la triade de symptômes caractérisant l’autisme, ce trouble neurodévelopmental est associé à des particularités perceptives et motrices et, au niveau cérébral, par une connectivité atypique entre les différentes régions du cerveau. Au niveau anatomique, un des résultats les plus communs est la réduction du corps calleux. Toutefois, des effets directs de cette altération anatomique sur l’intégrité et l’efficacité du transfert interhémisphérique restent à être démontrés. Pour la présente thèse, trois différentes études investiguent différents aspects du traitement de l’information visuomotrice : le transfert interhémisphérique entre les régions bilatérales motrices et visuelles, la vitesse de traitement perceptif, et les habiletés motrices visuellement guidées. Dans la première étude, le paradigme visuomoteur de Poffenberger a été utilisé pour mesurer le temps de transfert interhémisphérique (TTIH). L’imagerie par résonnance magnétique fonctionnelle (IRMf) et structurale ainsi que l’imagerie de diffusion ont aussi été utilisées pour étudier les réseaux cérébraux impliqués dans la tâche de Poffenberger. Les autistes ont été comparés à un groupe d’individus à développement typique. La deuxième étude avait pour but d’investiguer la vitesse de traitement perceptif en autisme. Dans la troisième étude, deux tâches motrices (Purdue et Annett) ont été utilisées pour examiner la nature et l’importance des déficits moteurs. La tâche de Purdue inclut deux conditions bimanuelles utilisées comme indice additionnel d’intégration interhémisphérique. Dans les études 2 et 3, le groupe d’autistes a aussi été comparé à un groupe d’individus Asperger afin de voir si, et comment, les deux sous-groupes peuvent être distingués en ce qui concerne le traitement visuel et les déficits moteurs. Aucune différence entre les groupes n’a été observée en termes de TTIH. Les résultats de l’étude IRMf révèlent des différences d’activations corticales en lien avec la tâche de Poffenberger. Dans les groupes d’autistes et de typiques, l’efficacité de la communication interhémisphérique était associée à différentes portions du corps calleux (frontales/motrices chez les typiques, postérieures/visuelles chez les autistes). De façon globale, les résultats de cette étude démontrent un patron atypique de transfert interhémisphérique de l’information visuomotrice en autisme, reflétant un rôle plus important des mécanismes visuels dans le comportement sensorimoteur possiblement en lien avec une réorganisation cérébrale. Les résultats des études comportementales 2 et 3 indiquent que les autistes excellent dans la tâche mesurant la vitesse de traitement perceptif alors que les Asperger accomplissent la tâche à des niveaux similaires à ceux des typiques. La nature des déficits moteurs diffère aussi entre les deux sous-groupes; la dextérité et la coordination bimanuelle est affectée chez les individus Asperger mais pas chez les autistes, qui eux sont plus atteints au niveau de la rapidité unimanuelle. Les sous-groupes d’autistes et de syndrome d’Asperger sont caractérisés par des profils cognitifs différents dont les particularités perceptives et motrices font partie intégrante.

Gestaltpädagogische Elemente in der Berufspädagogik. Potentielle Erträge gestaltpädagogischer Ansätze für die berufliche Bildung. Konzepte, Fundierung, Realisierungsformen.

Gestaltpädagogische Elemente in der Berufspädagogik Potentielle Erträge gestaltpädagogischer Ansätze für die berufliche Bildung - Konzepte, Fundierung, Realisierungsformen - Zusammenfassung: Berufsausbilder, Berufsschullehrer und Trainer in der Aus- und Weiterbildung werden heute mit vielfältigen Veränderungen konfrontiert. Aufgrund des Technikeinsatzes zeigt sich in vie-len Unternehmen ein Wandel der beruflich organisierten Arbeit. Die wirtschaftlichen, techni-schen und sozialen Systemzusammenhänge werden zunehmend komplexer, dynamischer, enger vernetzt und normativ unbestimmter. Die technologische Entwicklung, vor allem der Kommunikationsmedien, hat eine Temposteigerung der Informationsübermittlung zur Folge, die gleichzeitig das Wissen erhöht. Mit der Forderung nach Schlüsselqualifikationen und der Wiederentdeckung ganzheitlicher Arbeitssituationen ist das Bestreben nach Bildungskonzep-ten verbunden, die mit der Herausbildung von Kompetenzen, wie vernetztes, system- und handlungsbezogenes Denken in komplexen Kontexten, Abstraktionsvermögen, systemati-sches Verständnis von Organisationsinterdependenzen, Selbstständigkeit, Selbstverantwor-tung, soziale, methodische und kommunikative Kompetenz und Innovationskraft korrespon-dieren. Unter dem Blickwinkel der Gestaltpädagogik fällt auf, dass die Berufspädagogik Methoden und Techniken in der betrieblichen Aus- und Weiterbildung nutzt, die wesentliche Elemente der Gestaltpädagogik enthalten. Eine konkrete theoretische Fundierung und Einbettung in die Berufspädagogik fehlt jedoch bisher. Die primäre Zielsetzung der Arbeit ist, die theoretischen Grundlagen der Gestaltpädagogik herauszuarbeiten und sie mit der Berufspädagogik in Verbindung zu bringen. An Beispielen wird aufgezeigt, wie gestaltpädagogische Aspekte in die betriebliche Aus- und Weiterbildung einfließen. Dabei werden unter anderem auch die Grenzen und Potentiale der Gestaltpädago-gik für die Berufspädagogik betrachtet. Die theoretische und praktische Relevanz der Arbeit ergibt sich daraus, dass erstmals berufs-pädagogische Vorgehensweisen der Praxis im Hinblick auf gestaltpädagogische Aspekte un-tersucht wurden. Die wesentlichen Forschungsergebnisse dieser Arbeit lassen sich wie folgt zusammenfassen: In der betrieblichen Aus- und Weiterbildung kommen Methoden und Vorgehensweisen zum Einsatz, die oberflächlich betrachtet gestaltpädagogischen Charakter haben. Jedoch werden die gestaltpädagogischen Grundgedanken, wie z.B. eine ganzheitlich umfassende Persönlich-keitsentwicklung, persönlich bedeutsames Lernen, Förderung der sozialen Interaktionsfähig-keit oder die Förderung der Autonomie in der betrieblichen Bildungsarbeit auf ein Minimum reduziert. Die gestaltpädagogischen Methoden und Vorgehensweisen werden überwiegend auf ökonomische Zwecke hin ausgerichtet und funktionalisiert eingesetzt. Man kann sagen, dass sich die betriebliche Praxis mit der Aneinanderreihung von kreativen Übungen zufrieden gibt, und eine Tendenz zu erlebnisaktivierenden Vorgehensweisen zu erkennen ist.

Social interaction deficits and conversational inadequacy in Williams syndrome

Research on social communication skills in individuals with Williams syndrome has been inconclusive, with some arguing that these skills are a relative strength and others that they are a weakness. The aim of the present study was to investigate social interaction abilities in a group of children with WS, and to compare them to a group of children with specific language impairment and a group of typically developing children. Semi-structured conversations were conducted and 100-150 utterances were selected for analysis in terms of exchange structure, turn taking, information transfer and conversational inadequacy. The statistical analyses showed that the children with WS had difficulties with exchange structure and responding appropriately to the interlocutor's requests for information and clarification. They also had significant difficulties with interpreting meaning and providing enough information for the conversational partner. Despite similar language abilities with a group of children with specific language impairment, the children with WS had different social interaction skills, which suggests that they follow an atypical trajectory of development and their neurolinguistic profile does not directly support innate modularity. (c) 2005 Elsevier Ltd. All rights reserved.

A tool for replay and analysis of gaze-enhanced multiparty sessions captured in immersive collaborative environments

A desktop tool for replay and analysis of gaze-enhanced multiparty virtual collaborative sessions is described. We linked three CAVE (TM)-like environments, creating a multiparty collaborative virtual space where avatars are animated with 3D gaze as well as head and hand motions in real time. Log files are recorded for subsequent playback and analysis Using the proposed software tool. During replaying the user can rotate the viewpoint and navigate in the simulated 3D scene. The playback mechanism relies on multiple distributed log files captured at every site. This structure enables an observer to experience latencies of movement and information transfer for every site as this is important fir conversation analysis. Playback uses an event-replay algorithm, modified to allow fast traversal of the scene by selective rendering of nodes, and to simulate fast random access. The tool's is analysis module can show each participant's 3D gaze points and areas where gaze has been concentrated.

Changing building user attitude and organisational policy towards sustainable resource use in healthcare

Health care provision is significantly impacted by the ability of the health providers to engineer a viable healthcare space to support care stakeholders needs. In this paper we discuss and propose use of organisational semiotics as a set of methods to link stakeholders to systems, which allows us to capture clinician activity, information transfer, and building use; which in tern allows us to define the value of specific systems in the care environment to specific stakeholders and the dependence between systems in a care space. We suggest use of a semantically enhanced building information model (BIM) to support the linking of clinician activity to the physical resource objects and space; and facilitate the capture of quantifiable data, over time, concerning resource use by key stakeholders. Finally we argue for the inclusion of appropriate stakeholder feedback and persuasive mechanism, to incentivise building user behaviour to support organisational level sustainability policy.

Patterning and detailed study of human hNT astrocytes on parylene-C/silicon dioxide substrates to the single cell level

It is estimated that the adult human brain contains 100 billion neurons with 5–10 times as many astrocytes. Although it has been generally considered that the astrocyte is a simple supportive cell to the neuron, recent research has revealed new functionality of the astrocyte in the form of information transfer to neurons of the brain. In our previous work we developed a protocol to pattern the hNT neuron (derived from the human teratocarcinoma cell line (hNT)) on parylene-C/SiO2 substrates. In this work, we report how we have managed to pattern hNT astrocytes, on parylene-C/SiO2 substrates to single cell resolution. This article disseminates the nanofabrication and cell culturing steps necessary for the patterning of such cells. In addition, it reports the necessary strip lengths and strip width dimensions of parylene-C that encourage high degrees of cellular coverage and single cell isolation for this cell type. The significance in patterning the hNT astrocyte on silicon chip is that it will help enable single cell and network studies into the undiscovered functionality of this interesting cell, thus, contributing to closer pathological studies of the human brain.