Data compilation on the biological response to ocean acidification: environmental and experimental context of data sets and related literature

The exponential growth of studies on the biological response to ocean acidification over the last few decades has generated a large amount of data. To facilitate data comparison, a data compilation hosted at the data publisher PANGAEA was initiated in 2008 and is updated on a regular basis (doi:10.1594/PANGAEA.149999). By January 2015, a total of 581 data sets (over 4 000 000 data points) from 539 papers had been archived. Here we present the developments of this data compilation five years since its first description by Nisumaa et al. (2010). Most of study sites from which data archived are still in the Northern Hemisphere and the number of archived data from studies from the Southern Hemisphere and polar oceans are still relatively low. Data from 60 studies that investigated the response of a mix of organisms or natural communities were all added after 2010, indicating a welcomed shift from the study of individual organisms to communities and ecosystems. The initial imbalance of considerably more data archived on calcification and primary production than on other processes has improved. There is also a clear tendency towards more data archived from multifactorial studies after 2010. For easier and more effective access to ocean acidification data, the ocean acidification community is strongly encouraged to contribute to the data archiving effort, and help develop standard vocabularies describing the variables and define best practices for archiving ocean acidification data.

Pollen from 50 lake surface samples in Brandenburg, Germany, in 2009

Past changes in plant and landscape diversity can be evaluated through pollen analysis, however, pollen based diversity indexes are potentially biased by differential pollen production and deposition. Studies examining the relationship between pollen and landscape diversity are therefore needed. The aim of this study is to evaluate how different pollen based indexes capture aspects of landscape diversity. Pollen counts were obtained from surface samples of 50 small to medium sized lakes in Brandenburg (Northeast Germany) and compiled into two sets, with one containing all pollen counts from terrestrial plants and the second restricted to wind-pollinated taxa. Both sets were adjusted for the pollen production/dispersal bias using the REVEALS model. A high resolution biotope map was used to extract the density of total biotopes and different biotopes per area as parameters describing landscape diversity. In addition tree species diversity was obtained from forest inventory data. The Shannon index and the number of taxa in a sample of 10 pollen grains are highly correlated and provide a useful measure of pollen type diversity which corresponds best to landscape diversity within one km of the lake and the proportion of non-forested area within seven km. Adjustments of the pollen production/dispersal bias only slightly improve the relationships between pollen diversity and landscape diversity for the restricted dataset as well as for the forest inventory data and corresponding pollen types. Using rarefaction analysis, we propose the following convention: pollen type diversity is represented by the number of types in a small sample (low count e.g. 10), pollen type richness is the number of types in a large sample (high count e.g. 500) and pollen sample evenness is characterized by the ratio of the two. Synthesis. Pollen type diversity is a robust index that captures vegetation structure and landscape diversity. It is ideally suited for between site comparisons as it does not require high pollen counts. In concert with pollen type richness and evenness, it helps evaluating the effect of climate change and human land use on vegetation structure on long timescales.

Évaluation de différents sels et mélanges de sels pour lutter contre"Pseudomonas cichorii" dans la laitue

Ce projet avait pour objectif d’évaluer l’efficacité de certains sels utilisés comme agents de conservation dans l’industrie agroalimentaire et pharmaceutique pour lutter contre la maladie des taches et des nervures noires de la laitue (Lactuca sativa), causée par la bactérie Pseudomonas cichorii. L’étude a permis 1) de déterminer les concentrations minimales inhibitrices (MICs) des sels et de mélanges de ces sels envers des souches virulentes de P. cichorii et 2) d’évaluer l’effet de ces sels et mélanges de sels, appliqués à des concentrations avoisinant les MICs, sur le développement de la maladie. Les résultats obtenus montrent une réduction significative, bien que partielle et variable, de la gravité des symptômes de maladie suite à l’application de NaHCO3 (160 mM), de AlCl3 (4 mM) et des mélanges Na2S2O5 + CaCl2 (12 mM), Na2S2O5 + AlCl3 (4 mM) et Na2S2O5 + NaHCO3 (125 mM). À la lumière des résultats obtenus, il est clair que les sels testés dans le cadre de cette étude ne permettent pas une réduction suffisamment marquée de la maladie pour envisager la commercialisation des plants. On ne peut toutefois exclure la possibilité que ces sels puissent permettre une réduction suffisante de la maladie des taches et des nervures noires lorsqu’utilisés avec des méthodes complémentaires de lutte dans un programme de lutte intégrée.

Análisis preliminar de la fitotoxicidad del material particulado sedimentable de la zona urbana de Cuenca

Este artículo informa sobre la valoración de la fitotóxicidad del Material Particulado Sedimentable (MPS) en la zona urbana del cantón Cuenca. El MPS se recolectó en tres sitios de la zona urbana, mediante el método descrito en el Texto Unificado de Legislación Ambiental Secundaria del Ministerio del Ambiente (TULASMA). Por el material particulado se realizó la determinación de la concentración de los componentes utilizando el análisis gravimétrico, la de los metales pesados por espectroscopía de absorción atómica, y la de aniones por método adaptado de referencia EPA 300.1. Posteriormente se evaluó su fitotóxicidad en cuatro especies, mediante el bioensayo de germinación y elongación de raíz e hipocótilo, en semillas de Lactuca sativa, Brassica oleracea itálica, Allium cepa y Raphanus sativus. En el bioensayo las semillas se expusieron a diferentes diluciones de la suspensión acuosa de MPS. Los resultados muestran que el efecto de los MPS dependió de la concentración y de la especie analizada, evidenciando diferentes grados de fitotóxicidad.

Cadmium availability and accumulation by lettuce and rice

Among the toxic elements, Cd has received considerable attention in view of its association with a number of human health problems. The objectives of this study were to evaluate the Cd availability and accumulation in soil, transfer rate and toxicity in lettuce and rice plants grown in a Cd-contaminated Typic Hapludox. Two simultaneous greenhouse experiments with lettuce and rice test plants were conducted in a randomized complete block design with four replications. The treatments consisted of four Cd rates (CdCl2), 0.0; 1.3; 3.0 and 6.0 mg kg(-1), based on the guidelines recommended by the Environmental Agency of the State of São Paulo, Brazil (Cetesb). Higher Cd rates increased extractable Cd (using Mehlich-3, Mehlich-1 and DTPA chemical extractants) and decreased lettuce and rice dry matter yields. However, no visual toxicity symptoms were observed in plants. Mehlich-1, Mehlich-3 and DTPA extractants were effective in predicting soil Cd availability as well as the Cd concentration and accumulation in plant parts. Cadmium concentration in rice remained below the threshold for human consumption established by Brazilian legislation. on the other hand, lettuce Cd concentration in edible parts exceeded the acceptable limit.

Aspectos sanitários do cultivo da alface americana, irrigada com águas recptoras de efluentes urbanos

Avaliou-se a influência da disposição de mangueiras gotejadoras nos canteiros e a injeção ou não de cloro na água de irrigação, nas condições sanitárias do solo e da alface americana irrigada (Lactuca sativa L.) com águas receptoras de efluentes urbanos. Foram realizadas análises microbiológicas de amostras de água do solo e da alface, no decorrer de todo o ciclo de cultivo. Objetivou-se determinar a possível existência de Salmonella spp. e de formas evolutivas de parasitos humanos e a quantidade de coliformes fecais, em pontos e épocas diferentes do experimento, impedindo assim o consumo da alface. Os resultados não indicaram a presença dos dois primeiros em nenhuma das amostras, mas sim de parasitos não humanos (nematóides) de vida livre no solo. em relação à quantidade de coliformes fecais (NMP ml-1), o valor encontrado na cultura atende às exigências da Secretaria de Vigilância Sanitária do Ministério da Saúde brasileiro, porém a presença dos nematóides em quantidades superiores ao permitido pela Organização Mundial de Saúde (OMS) inviabiliza o seu consumo.

Characterization of Atrazine-Loaded Biodegradable Poly(Hydroxybutyrate-Co-Hydroxyvalerate) Microspheres

Polyhydroxybutyrate-co-hydroxyvalerate microspheres (PHBV-MS) were prepared as a delivery system for the herbicide atrazine (ATZ). Characterization of the system included investigation of in vitro release properties and genotoxicity. ATZ - PHBV-MS particle diameters showed a size distribution range of 1-13 mu m. Differential scanning calorimetry analyses indicated that ATZ was associated with the PHBV microparticles. The release profiles showed a different release behavior for the pure herbicide in solution, as compared with that containing ATZ-loaded PHBV-MS. Korsmeyer-Peppas model analyses showed that atrazine release from the microparticles occurred by a combination of diffusion through the matrix and partial diffusion through water-filled pores of the PHBV microparticles. A Lactuca sativa test result showed that the genotoxicity of ATZ-loaded PHBV-MP was decreased in relation to ATZ alone. The results demonstrate a viable biodegradable herbicide release system using atrazine for agrochemical purposes.

Manuseio pós-colheita de alface.

2008

Atividade fitotóxica de extratos e exsudatos radiculares de Guilandina bonduc (Fabaceae)

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Departamento de Botânica, Programa de Pós-Graduação em Botânica, 2015.

Produção de alface americana em função da adubação nitrogenada nas condições de primavera em Jataí-GO.

O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito da aplicação de duas fontes de nitrogênio (ureia e NovaTec®) na produção da alface americana, nas condições de primavera, em Jataí-GO. Foram utilizadas mudas da cultivar de alface americana Lucy Brown, sendo avaliadas as características: massa fresca total e comercial, número de folhas, diâmetro e comprimento de caule. Verificou-se que todas as características avaliadas foram influenciadas pela adubação com ureia enquanto que NovaTec® influenciou apenas o comprimento de caule e as massas fresca total e comercial. A dose de 61 kg ha-1 de ureia em cobertura, proporcionou a maior massa fresca comercial.

Desempenho de cultivares de alface roxa sob cultivo protegido em duas épocas do ano em Iranduba, AM.

Devido à escassez de informações referentes à adaptação de cultivares de alface roxa no Estado do Amazonas, o objetivo deste trabalho será avaliar a produção de cultivares de alface roxa sob cultivo protegido, em duas épocas do ano.

Compostagem de resíduos urbanos e seu efeito na qualidade comercial da alface-americana em Manaus, AM.

O objetivo deste estudo foi avaliar a qualidade nutricional de compostos orgânicos em duas técnicas e períodos de compostagem e seu efeito nas características comerciais da alface-americana (Lactuca sativa).

Primeiro relato de Tomato chlorotic spot virus em alface no estado do Pará.

A alface é uma hortaliça folhosa de grande importância econômica e social no Brasil, pois bastante cultivada por pequenos produtores e em hortas familiares. Isto ocorre principalmente pela facilidade que a cultura apresenta em se adaptar às mais diferentes condições. As doenças causadas por vírus são as principais responsáveis pelas perdas na produção na cultura, entre elas destacam-se as causadas por vírus do gênero Tospovirus. Durante visitas realizadas a áreas produtoras de hortaliças localizadas na região metropolitana de Belém-Pará, foi observada a alta incidência de plantas com sintomas de viroses. Assim, o trabalho teve como objetivo identificar o agente causal do vira cabeça da alface, por meio de RT-PCR e sequenciamento do ácido nucléico. Para isso, foi feita a extração de ácidos nucleicos total a partir de folhas de alface com sintoma de vira-cabeça e, posteriormente foi realizado o RT-PCR utilizando os primers universais para o gênero Tospovirus. O produto do PCR foi sequenciado e avaliado nos programas Blast, ClustalW e Mega 7.0. A partir da análise da filogenia foi observado que os isolados formaram um clado com os acessos da espécie Tomato chlorotic spot virus (TCSV). Este foi o primeiro relato de TCSV em alface no Estado do Pará

Identificação molecular de Groundnut ringspot virus em alface no município de Altamira.

A alface (Lactuca sativa L.), pertencente a família Asteracea, é uma das principais hortaliças folhosas cultivadas no Brasil. Em um cultivo de alface no município de Altamira, Estado do Pará, observou-se plantas apresentando manchas necróticas e bronzeamento das folhas, sintomas característicos de Tospovirus. O objetivo do trabalho foi identificar a espécie viral através dos testes de RT-PCR e sequenciamento do DNA. Para isso, amostras das plantas doentes foram levadas ao laboratório de fitopatologia da Embrapa Amazônia Oriental para realizar a extração do DNA e RT-PCR utilizando primers universais para o gênero Tospovirus (BR60/BR65). O produto do RT-PCR foi purificado e enviado para sequenciamento. As sequências foram avaliadas utilizando os programas Blastn, ClustalW e MEGA 7.0. Os isolados de alface provenientes do município de Altamira-PA foram identificados como Groundnut ringspot virus (GRSV).