Detecção e Quantificação de Neurónios em C.elegans

Nesta dissertação é apresentado um estudo dos sistemas de processamento automático de imagem em contexto de um problema relacionado com a individualização de neurónios em imagens da nematoda C. elegans durante estudos relacionados com a doença de Parkinson. Apresenta-se uma breve introdução à anatomia do verme, uma introdução à doença de Parkinson e uso do C. elegans em estudos relacionados e também é feita a análise de artigos em contexto de processamento de imagem para contextualizar a situação atual de soluções para o problema de extração de características e regiões específicas. Neste projeto é desenvolvida uma pipeline com o auxilio do software CellProfiler para procurar uma resposta para o problema em questão.

População de Pratylenchus brachyurus no cultivo de soja e sua influência na produtividade de grãos.

As limitações legais para o avanço da cultura da soja em novas áreas, pelo valor pouco atrativo do milho segunda safra e pelo baixo vigor das sementes recebidas, o interesse do produtor em cultivar soja na segunda safra tem sido crescente no Estado de Mato Grosso. Entretanto, o cultivo de soja na segunda safra possui entraves que limitam a produtividade, como o menor fotoperíodo e o maior risco de ocorrência de seca no período reprodutivo da cultura. Outra preocupação é a multiplicação e a manutenção dos nematoides das lesões radiculares (P. brachyurus ) em altas populações no solo, quando se cultivam plantas hospedeiras durante longo período do ano. Há relatos de perdas de até 50% na produtividade de grãos de soja, em lavouras comerciais da região Centro - Oeste infestadas com P. brachyurus (FRANCHINI et al., 2014). Além da ação espoliadora e mecânica, esse nematóide causa ferimentos nas raízes o s quais favorecem a entrada de fungos e bactérias, potencializando os danos e levando à diminuição da produtividade (FONSECA, 2012). A rotação com culturas não hospedeiras é a principal forma de controle desses parasitas, visto que não existem fontes de resistência varietal. O objetivo do trabalho foi o de avaliar a influência de sucessões de cultura, principalmente de soja sobre soja 2ª safra, na população do nematoide das lesões radiculares e na produtividade de grãos na cultura da soja cultivada na safra.

Mermithid (nematoa: mermithidae) infections of black flies (Diptera: Simuliidae) : seasonal variation and developmental characteristics /

Mermithid nematodes (Nematoda: Mermithidae) parasitize larval, pupal and adult black flies (Diptera: Simuliidae), oftentimes resulting in partial or complete host feminization. This study was designed to characterize parasite-host seasonal variation and to estabUsh the developmental life stage at which feminization is initiated. Data indicate that the total adult population of black flies collected from Algonquin Provincial Park throughout the spring of 2004 was comprised of 31.8% female, 67.8% male and 0.4% intersex individuals. Of the total population, 0.6% was infected by mermithid nematodes (69.0% female, 3.5% male and 27.6% intersex). Seasonal infection trends established over a 12-month period revealed that black flies with different life histories host the same mermithid subfamilies, while black flies with similar life histories host mermithids from different subfamilies. If a simuliid species simultaneously hosts two mermithid species, these parasites are from different subfamilies. Molecular mermithid identification revealed two mermithid subfamilies, Me.somermithinae and Gastromermithinae, present in the simuliid hosts. Mermithid colour variation was not found to be a reliable species indicator. The developmental stage at which feminization is initiated was determined by examining gonad morphology and meiotic chromosomal condition. Results indicate that mermithid-infected black flies exhibit feminization prior to larval histoblast formation. Larvae can be morphologically male (testes present) or female (ovaries present), with morphological males exhibiting either male (achiasmate) or female (chiasmate) meiotic chromosomes; morphological females were only genetically female. Additionally, mermithid infection inhibits simuliid gonad development.

lmpact of bottom trawling on benthic ecology along the coastal waters of Kerala with special reference to meiofauna

School of Industrial Fisheries, Cochin University of Science and Technology

Some biological data on cetaceans populations present in the western coasts of Ireland

Ireland’s waters constitute one of the richest habitats for cetaceans in Europe. Marine mammals, particularly cetaceans, are known to be definitive hosts of digestive parasites from the Fm.Anisakidae. The main aim of this study is to collect and compile all the information available out there regarding parasites of the Fm. Anisakidae and their definitive hosts. Secondary objectives are to relate the presence of cetacean species with the presence of parasites of the Fm. Anisakidae and to determine whether this greater number of cetaceans relates to a greater level of parasitism. Prevalence and burdens of anisakids in definitive hosts vary widely with host species, geographic location, and season. Results from several post-mortem exams are given. However, they cannot be compared due to differences in collecting techniques. Anisakis simplex is the most commonly and widespread parasite found in the majority of the samples and in a major number of hosts, which include harbour porpoise, short-beaked common dolphin and bottlenose dolphin. Studies on harbour porpoise obtained prevalences of Anisakis spp. of 46% (n=26) and of 100% (n= 12). Another study in common dolphin reported a prevalence of 68% (n=25). Several reasons could influence the variations in the presence of Anisakis. Studies on commercially exploited fish have reported prevalences of Anisakis simplex ranging from 65-100% in wild Atlantic salmon and from 42-53.4% in Atlantic cod

Oscheius tipulae as an example of eEF1A gene diversity in nematodes

We characterized four eEF1A genes in the alternative rhabditid nematode model organism Oscheius tipulae. This is twice the copy number of eEF1A genes in C. elegans, C. briggsae, and, probably, many other free-living and parasitic nematodes. The introns show features remarkably different from those of other metazoan eEF1A genes. Most of the introns in the eEF1A genes are specific to O. tipulae and are not shared with any of the other genes described in metazoans. Most of the introns are phase 0 (inserted between two codons), and few are inserted in protosplice sites (introns inserted between the nucleotide sequence A/CAG and G/A). Two of these phase 0 introns are conserved in sequence in two or more of the four eEF1A gene copies, and are inserted in the same position in the genes. Neither of these characteristics has been detected in any of the nematode eEF1A genes characterized to date. The coding sequences were also compared with other eEF1A cDNAs from 11 different nematodes to determine the variability of these genes within the phylum Nematoda. Parsimony and distance trees yielded similar topologies, which were similar to those created using other molecular markers. The presence of more than one copy of the eEF1A gene with nearly identical coding regions makes it difficult to define the orthologous cDNAs. As shown by our data on O. tipulae, careful and extensive examination of intron positions in the eEF1A gene across the phylum is necessary to define their potential for use as valid phylogenetic markers.

Diversidade e potencial zoonótico de parasitos de Didelphis albiventris Lund, 1841 (Marsupialia: Didelphidae)

Didelphis albiventris, gambá-de-orelha-branca, é um marsupial de hábitos crepusculares e noturnos que se alimenta de frutos, insetos, pequenos répteis e anfíbios, filhotes de aves e pequenos mamíferos. Com a destruição de seu “habitat” natural devido às queimadas e desmatamentos, esses animais têm-se aproximado, cada vez mais, das regiões peridomiciliar e domiciliar, onde procuram abrigo e alimentos. Com o objetivo de conhecer a diversidade de parasitos de D. albiventris e relatar os que apresentam potencial zoonótico, foram examinados 30 exemplares desta espécie, através de necropsia, para coleta de ectoparasitos da superfície externa do corpo e helmintos dos órgãos e conteúdos estomacal e intestinal. Os sifonápteros foram removidos da superfície externa dos animais, conservados em álcool etílico a 70°GL, clarificados em líquido de Nesbitt, desidratados em etanol, diafanizados em creosoto de Faya e montados em lâminas com bálsamo do Canadá para identificação. Os carrapatos foram removidos da superfície externa dos animais, conservados em álcool etílico a 70°GL e identificados ao estereomicroscópio, segundo chaves específicas de Aragão & Fonseca (1961) e Guimarães et al (2001). Os helmintos foram recolhidos com auxílio de estiletes e pinças, clarificados em lactofenol e montados entre lâminas e lamínulas com bálsamo do Canadá para identificação ao microscópio. Do total de animais examinados, 70% estavam infestados com pulgas das espécies Polygenis (Neopolygenis) atopus, Polygenis (Polygenis) rimatus, Polygenis (Polygenis) roberti roberti, Polygenis (Polygenis) sp., Craneopsylla minerva minerva e Ctenocephalides felis felis, todas essas registradas pela primeira vez sobre D. albiventris e, exceto C. felis felis, são também registradas pela primeira vez no estado do Rio Grande do Sul. Carrapatos foram encontrados em 43,33% dos animais examinados, representados pelas espécies Ixodes loricatus, Amblyomma aureolatum e Amblyomma sp, sendo A. aureolatum registrado pela primeira vez parasitando D. albiventris no Brasil. Os helmintos encontrados foram: Filo Nematoda - Capillaria spp. (esôfago, traquéia, faringe e pulmão), Didelphostrongylus hayesi (pulmão), Turgida turgida (estômago), Gnathostoma sp. (estômago e fígado), Travassostrongylus orloffi, Viannaia hamata e Trichuris minuta no intestino delgado e Trichuris didelphis, Cruzia tentaculata e Aspidodera raillieti no intestino grosso; Classe Trematoda – Echinostoma revolutum, Plagiorchis didelphidis, Rhopalias coronatus, R. baculifer, Brachylaema migrans e Didelphodiplostomum variabile, todos no intestino delgado; Classe Cestoda – exemplares da família Diphyllobotriidae, no intestino delgado; e Filo Acanthocephala – Hamanniella microcephala e Centrorhynchus sp., ambos no intestino delgado. Dos helmintos encontrados, os que apresentam potencial zoonótico segundo a literatura são T. turgida, Gnathostoma sp., Capillaria spp., B. migrans, E. revolutum e Família Diphyllobotriidae. Além disso, os sifonápteros e ixodídeos encontrados são potenciais vetores de patógenos que infectam humanos. D. albiventris, portanto, apresenta grande diversidade parasitária, incluindo espécies que podem potencialmente atingir o homem, alertando para a importância destes marsupiais na disseminação de doenças entre animais e humanos.

Padrões espaciais e temporais da comunidade de invertebrados bentônicos no estuário Tramandaí-Armazém, RS, e a resposta da macro e meiofauna a um derrame experimental de óleo bruto

A distribuição espaço-temporal dos invertebrados bentônicos, no estuário Tramandaí-Armazém, localizado no Litoral Norte do Rio Grande do Sul, Brasil, foi analisada em três sub-ambientes: laguna Armazém (3 áreas amostrais), laguna Tramandaí (3 áreas amostrais) e Canal de ligação com o Oceano Atlântico (1 área amostral). Na laguna Tramandaí, ocorre um aporte de água doce pelo rio Tramandaí, na laguna Armazém, ocorre a entrada mais freqüente da cunha salina e no Canal verifica-se uma maior influência do Oceano Atlântico. No ARTIGO I, foram analisados os organismos da meiofauna, obtidos a partir de amostragens sazonais em 2000. Em cada área foram tomadas seis amostras, até a profundidade de 5 cm no interior do sedimento, com um corer de 2,7cm de diâmetro. Nematoda foi o grupo taxonômico dominante em todos os ambientes. As análises uni e multivariadas mostraram que a estrutura da meiofauna na laguna Armazém, caracterizada pelas densidades mais elevadas, difere significativamente dos demais ambientes amostrados. A similaridade das amostras coletadas na laguna Tramandaí e no Canal ocorreu em quase todas as estações, com exceção da primavera. Picos de densidade da meiofauna foram encontrados no verão. Os resultados sugerem que os fatores abióticos, como salinidade, hidrodinâmica e temperatura, são importantes condicionantes desta variabilidade espaço-temporal detectada. No ARTIGO II, detalhou-se a identificação de Nematoda, em gênero, e sua classificação em grupo trófico. As análises multivariadas mostraram que a associação de Nematoda é distinta entre os três ambientes analisados. Os atributos densidade, diversidade e riqueza de gêneros foram significativamente mais elevados na laguna Armazém. Nesta laguna, os nematódeos comedores de epistrato e de bactérias foram os dominantes, enquanto que no Canal e Tramandaí prevaleceram os comedores de depósito e predadores facultativos. Uma variabilidade temporal foi detectada tanto para os gêneros, como para os grupos tróficos, com densidades mais elevadas no verão. A identificação de Nematoda e de seu comportamento alimentar mostraram que além da salinidade, hidrodinâmica e temperatura, a disponibilidade de alimento e a forma como está disponível, determinam a estrutura desta associação. No ARTIGO III, foi analisada a distribuição espaço-temporal da macrofauna, a partir de amostragens sazonais entre o outono de 2002 e o verão de 2003. Em cada área foram obtidas 6 amostras com um corer de 10cm de diâmetro enterrado até a profundidade de 20 cm no interior do sedimento. No Canal, a comunidade da macrofauna, foi caracterizada pelas menores densidades e riqueza específica, em todas as estações do ano. Diferente do verificado para Nematoda, a estrutura da macrofauna, encontrada na laguna Armazém e laguna Tramandaí foi similar. Este resultado se deve a baixa riqueza específica da macrofauna e a dominância de espécies oportunistas. Em situações de maior oferta de alimento, oriunda da decomposição de detritos (no inverno) e ao aparecimento da macrófita Ruppia maritima (na primavera), observou-se uma diferenciação da estrutura da macrofauna encontrada na laguna Armazém da laguna Tramandaí. Na laguna Armazém densidades mais elevadas ocorreram no inverno, nos demais ambientes não foram constatadas diferenças significativas entre as estações. Provavelmente as características geomorfológicas do estuário e a hidrodinâmica atuante promovam uma instabilidade em todo o estuário, que para a macrofauna se sobrepõem às diferenças ambientais encontradas entre as lagunas. No ARTIGO IV, avaliou-se a macro e meiofauna, frente a um derrame experimental de óleo, através de análises univariadas. No experimento foram considerados dois fatores: tratamento (controle, corer sem óleo, corer com óleo) e tempo (4 e 9 horas após a adição do óleo). Cada tratamento constou de cinco réplicas, nos dois períodos de coleta. Não foram detectados efeitos do óleo sobre a macrofauna, no tempo de 4 horas e 9 horas de exposição. Para a meiofauna e gêneros de Nematoda, não foram encontradas variações significativas de densidade, com exceção do gênero Theristus, que apresentou um maior número de organismos mortos na presença do óleo.

Histopathology findings in common marmosets (Callithrix jacchus Linnaeus, 1758) with chronic weight loss associated with bile tract obstruction by infestation with Platynosomum (Loos, 1907)

Chronic weight loss in marmosets is often associated with wasting marmoset syndrome (WMS), an important disease that occurs in callitrichid colonies around the world. Even though its etiology is very difficult to determine, particular variables, such as weight loss, diarrhea and alopecia, associated or not with infestation in the pancreatic ducts with Trichospirura leptossoma (Nematoda: Thelazioidea), seem to be linked with the syndrome. This study investigated the histopathology of the lungs, duodenum, liver, gallbladder, extrahepatic bile ducts and pancreatic ducts of six common marmosets (Callithrix jacchus) suffering from severe non-diarrheic weight loss. Three individuals died naturally and the other three were euthanized. Microscopic findings showed the presence of adult flukes (Platynosomum) in the liver. These flukes, which provoke common infection in cats, were also observed inside the gallbladder as well as in the intra and extrahepatic bile ducts in common marmosets. Portal fibrosis was observed in two animals, which developed chronic fibrosing hepatopathy (biliary pattern, grade 3). The disease progresses without diarrhea and without pancreatic lesions or infestation. With the rogression, the animals presented with ascending cholangitis, cholestasis and portal fibrosis, sometimes culminating in secondary biliary cirrhosis. Therefore, this nfirmity, associated with chronic weight loss in common marmosets, could be another tiological factor linked with WMS

Parasitology of juvenile mullet (Mugil liza) and effect of formaldehyde on parasites and host

Few studies have been performed with parasites of marine and estuarine fish in southern Brazil. In the present study, unpublished results show the ways of parasitism of juvenile mullet by parasites. The toxicity of formaldehyde and the effectiveness of this chemotherapy in controlling parasites in reared juvenile mullet Mugil liza were also studied. Juvenile mullets (1 +/- 0.26 g; 4.1 +/- 0.4 cm) were exposed to different concentrations of 37% formaldehyde: control group and five formaldehyde concentrations which were tested: T1 (13.5), T2 (21.6), T3 (40.5), T4 (81) and T5 (135) mg L-1 with 8 fish per repetition in triplicate. To verify the drug effectiveness in parasitic control, juvenile mullets were exposed to 1 h prophylactic bath of 37% formaldehyde with a control group and five formaldehyde concentrations: T1 (67.5), T2 (135), T3 (270), T4 (405) and T5 (540) mg L-1, 8 fish per repetition in triplicate. Ligophorus cf. uruguayensis (Monogenoidea: Ancyrocephalidae) and Solostamenides cf. platyorchis (Monogenoidea: Microcotylidae) were identified in the gills. Digenea and Nematoda were observed in the intestines. This is the first occurrence of S. cf. platyorchis in Brazil. During the toxicity test, the LC50-96 h was estimated at 20.77 mg L-1 of formaldehyde. During the 1 h formaldehyde prophylactic bath, all parasites were eliminated in formaldehyde concentrations between 135 and 540 mg L-1. High survival rate was observed in all treatments. Values of prevalence and intensity of infestation observed in this study showed the potential damage caused by Monogenoidea to mullet. Formaldehyde baths with 135 mg L-1 are recommended to control Monogenoidea in mullet and the safe limits for formaldehyde use were presented. Besides, the endoparasites were tolerant to formaldehyde exposure. (C) 2012 Elsevier B.V. All rights reserved.

Evaluation of the possible role of ants (Hymenoptera: Formicidae) as mechanical vectors of nematodes and protists

Os Nematoda e Protista podem ser transmitidos ao homem de diversas maneiras, mas pouca ênfase é dada para a transmissão mecânica por intermédio de formigas. Assim, esse trabalho procurou investigar a transmissão mecânica de ovos de Ascaris lumbricoides e cistos de Entamoeba coli pelos Formicidae. Através de experimentos com espécies mantidas em ninhos no laboratório (Tapinoma melanocephalum, Linepithema humile e Monomorium pharaonis) e com 17 espécies de formigas de uma área antropizada na região de Mogi as Cruzes (SP), foi possível constar que os ovos A. lumbricoides foram transportados por L. humile, tanto no campo (1 operária) como no laboratório (1 operária), por Camponotus rufipes (2), por Solenopsis saevissima (1) e por Acromyrmrex niger (1). em três operárias de C. rufipes foram encontrados cistos de E. coli. Apesar da baixa incidência de transporte, as três primeiras espécies pelo fato de viverem muito próximas ao ser humano, podem levar para dentro do ambiente domiciliar patógenos de Nematoda e Protista.

Natural infection of gastrointestinal nematodes in long-nosed armadillos Dasypus novemcinctus Linnaeus, 1758 from Pantanal wetlands, Aquidauana sub-region, Mato Grosso do Sul State, with the description of Hadrostrongylus speciosum n. gen. et n. sp (Molineidae : Anoplostrongylinae)

This study evaluated the gastrointestinal helminth fauna of long-nosed armadillos, Dasypus novemcinctus, from the Pantanal wetlands, Aquidauana sub-region, Aquidauana County, Mato Grosso do Sul State, Brazil. Thirteen species of nematodes, comprising seven genera and four families, were recovered from their gastrointestinal tracts. The following descriptors of infection were determined: prevalence, variation of intensity, average intensity and abundance. Hadrostrongylus speciosum n. gen. et n. sp. is first described here. (c) 2006 Published by Elsevier B.V.

Natural infections with filarioidea nematodes in Hydrochaerus hydrochaeris in the floodplain of Mato Grosso do Sul, Brazil

Foram coletados 570 nematódeos Filaroidea de 36 capivaras, sacrificadas entre 1989 e 1996, onze jovens menores que seis meses e 25 adultas, provenientes da região do pantanal do Mato Grosso do Sul (Paiaguás). Cento e setenta e seis (176) espécimes de Yatesia hydrochoerus foram encontrados nas fáscias dos músculos esqueléticos, principalmente da região do obliquus externus abdominis e na face interna dos membros posteriores e trezentos e noventa e quatro (394) espécimes de Cruorifilaria tuberocauda foram coletados das artérias renais (380) e das artérias pulmonares (14) dos animais.

Application technology for the entomopathogenic nematodes Heterorhabditis indica and Steinernema sp. (Rhabditida: Heterorhabditidae and Steinernematidae) to control Spodoptera frugiperda (Smith) (Lepidoptera: Noctuidae) in corn

O efeito de diversas tecnologias de aplicação foi avaliado sobre a concentração, viabilidade e eficácia dos juvenis infectantes dos nematóides Heterorhabditis indica Poinar, Karunakar & David (IBCB-n5) e Steinernema sp. (IBCB-n6) no controle da lagarta-do-cartucho Spodoptera frugiperda Smith na cultura do milho. Para o controle da lagarta-do-cartucho no terceiro estádio em placas de Petri foram necessários 280 juvenis infectantes de Steinernema sp., enquanto que 400 juvenis infectantes de H. indica controlaram apenas 75% das lagartas. Podem-se pulverizar os entomopatógenos, sem que haja perda significativa na sua concentração e viabilidade, com equipamentos que forneçam carga elétrica à calda, ponta centrífuga e pontas hidráulicas. Entretanto, o emprego de pulverizadores com pontas que requerem elementos filtrantes com malha igual a 100 resultou em decréscimo na concentração de juvenis infectantes de H. indica e Steinernema sp., de 28% e 53%, respectivamente. Os tensoativos organosiliconado e etoxilados não afetaram a viabilidade dos juvenis infectantes de Steinernema sp. Nos experimentos de pulverização em plantas de milho (V6) com Steinernema sp., doses equivalentes a até 288 milhões de juvenis infectantes por hectare, diluídos em volume de calda de até 800 L ha-1 com 0,01 % do tensoativo etoxilado, ou nesse volume seguido de exposição a chuva artificial (lâmina de água de 6 mm), não foram suficientes para o controle de S. frugiperda em casa-de-vegetação.

HELMINTH FAUNA of TWO GECKO LIZARDS, HEMIDACTYLUS AGRIUS and LYGODACTYLUS KLUGEI (GEKKONIDADE), FROM CAATINGA BIOME, NORTHEASTERN BRAZIL.

This study presented data on helminth fauna of two gecko lizards, Hemidactylus agrius and Lygodactylus klugei, from Caatinga biome in northeastern Brazil. It was found four helminth species parasitizing H. agrius, cistacanth of Centrorhynchidae (Acanthocephala) and the nematodes Physalopteridae (larvae), Parapharyngodon alvarengai (Pharyngodonidae) and Skrjabinelazia sp. (Seuratidade). The host Lygodactylus klugei presented two helminth species, one individual of Mesocoelium monas (Trematoda: Mesocoeliidae) in the small intestine and one encysted larvae of Physalopteridae (Nematoda: Physalopteridae) attached at stomach wall. The lizard species showed a low prevalence and low richness of helminths. Moreover, H. agrius presented a low intensity of infection. The foraging mode, arboreal habit and a restricted composition of diet could favoring the low prevalence, low infection rates and low richness of helminths found in these geckonid host species.