59 resultados para phylogenetics

em Repositório Institucional UNESP - Universidade Estadual Paulista "Julio de Mesquita Filho"


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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

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No Estado do Tocantins, no Norte do Brasil, a incidência de rizoctoniose no arroz é importante, causando danos significativos em lavouras de arroz irrigado. O principal objetivo deste trabalho foi determinar o grupo de anastomose (AG) de isolados de R. solani associados ao arroz naquela região, testando a hipótese de que esses isolados pertencem ao grupo padrão de anastomose AG-1 IA, que também é o agente causal da mela em soja em áreas úmidas do Norte do Brasil. Todos os quatro isolados de arroz foram caracterizados, através de fusão de hifas, como AG-1 IA. A caracterização cultural, em função das temperaturas basais (mínimas, máximas e ótimas), evidenciou que os isolados de R. solani de arroz apresentaram perfis semelhantes aos padrões AG-1 IA, AG-1 IB e AG-1 IC. Os isolados de arroz foram caracterizados como autotróficos para tiamina assim como os isolados padrões AG-1 IA, IB, IC, AG-4 HGI e o isolado da mela da soja. O teste de patogenicidade em plantas de arroz cultivar IRGA-409 e de patogenicidade cruzada à cultivar IAC-18 de soja (suscetível à mela), indicou que além de causar a queima da bainha em arroz, esses isolados causam mela em soja. da mesma forma, o isolado SJ-047 foi patogênico ao arroz. As seqüências de bases de DNA da região ITS-5.8S do rDNA dos isolados do arroz foram similares às seqüências do AG-1 IA, depositadas no GenBank® - NCBI. A filogenia do ITS-rDNA indicou um grupo filogenético comum formado pelos isolados do arroz, o isolado da soja e o isolado teste do AG-1 IA. Assim, com base em características citomorfológicas, culturais, filogenéticas e patogênicas, foi confirmada a hipótese de que os isolados de R. solani patógenos de arroz do Estado do Tocantins pertencem ao grupo de anastomose AG-1 IA, além da indicação de que esses isolados podem também causar a mela em soja.

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The family Callichthyidae comprises eight genera of fishes widely distributed across the Neotropical region. In the present study, sequences of the mitochondrial genes 12S rRNA, 16S rRNA, ND4, tRNA(His), and tRNA(Scr) were obtained from 28 callichthyid specimens. The sample included 12 species of Corydoras, three species of Aspidoras, two species of Brochis, Dianema, Lepthoplosternum, and Megalechis, and two local populations of Callichthys and Hoplosternum. Sequences of Nematogenys inermis (Nematogenyidae), Trichomycterus areolatus, and Henonemus punctatus (Trichomycteridae), Astroblepus sp. (Astroblepidae), and Neopleeostomus paranensis, Delturus parahybae, and Hemipsilichthys nimius (Loricariidae) were included as the outgroup. Phylogenetic analyses were performed by using the methods of maximum parsimony and maximum likelihood. The results of almost all analyses were very similar. The family Callichthyidae is monophyletic and comprises two natural groups: the subfamilies Corydoradinae (Aspidoras, Brochis, and Corydoras) and Callichthyinae (Callichthys, Dianema, Hoplosternum, Lepthoplosternum, and Megalechis), as previously demonstrated by morphological studies. The relationships observed within these subfamilies are in several ways different from those previously proposed on the basis of morphological data. Molecular results were compared with the morphologic and cytogenetic data available on the family. (C) 2003 Elsevier B.V. All rights reserved.

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Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

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