Isolation and characterization of Streptococcus dysgalactiae from diseased Acipenser schrenckii

Streptococcosis became an increasingly significant health problem in intensive aquaculture in China. Fifteen strains of Gram-positive, chain-forming coccus were isolated from moribund Amur sturgeon, Acipenser schrenckii, fanned with high density in central China. The coccoid microorganism was identified as Streptococcus dysgalactiae by means of physiological. biochemical properties and molecular analysis; furthermore, this coccus was confirmed as pathogen of sturgeon by challenge experiments and its infection potential on the cyprinid was also evaluated. To our knowledge, this was the first report of S. dysgalactiae linked to diseased A. schrenckii. (C) 2009 Elsevier B.V. All rights reserved.

卧龙自然保护区不同海拔的中国沙棘(Hippophae rhamnoides subsp. sinensis)天然群体的遗传多样性分析

中国沙棘是一种雌雄异株、风媒传粉的灌木或乔木，在中国西南的卧龙自然保护区有广泛的分布。本研究以采集于四川卧龙自然保护区5 个海拔(1800 m、2200 m、2600 m、3000 m、3400 m)梯度的中国沙棘天然群体为材料，以ISSR 和AFLP 标记技术研究其遗传多样性水平及其遗传结构，旨在了解卧龙地区中国沙棘天然群体的遗传多样性水平以及遗传多样性在群体间、群体内以及雌雄亚群体间的分布和特征，为中国沙棘树种的遗传改良及种质资源保存提供遗传研究背景与实验依据。同时探讨ISSR、AFLP 和RAPD三种标记对中国沙棘天然群体的遗传变异水平和群体间遗传结构的评估能力和各自的优缺点。研究得出以下主要结论： 1. ISSR和AFLP分析都表明卧龙自然保护区的中国沙棘群体拥有较高的遗传变异水平(h = 0.249，HT = 0.305)。出现这种结果的主要原因可能与卧龙自然保护区多变的气候条件和生境的异质度大有关。 2. ISSR 和AFLP 都揭示出卧龙自然保护区中国沙棘群体的遗传多样性随着海拔的增加发生显著的变化，表现为中海拔群体(2200 m 和2600 m)比高海拔群体(3000 m 和3400 m)和低海拔群体(1800 m)有更高的遗传多样性的趋势。出现这种趋势的可能解释是低海拔群体处在相对高温和相对干旱的环境，高海拔群体受到低温和紫外线胁迫，而中海拔群体存在中国沙棘生长的适宜环境。 3. ISSR 和AFLP 分析都表明：卧龙自然保护区中国沙棘的遗传结构遵循分布范围广、交配系统以异交为主的木本植物的通常模式，即大多数的遗传变异存在于群体内，只有少部分的遗传变异存在于群体间。 4. 经Mantel 检测表明，卧龙自然保护区中国沙棘群体间的海拔距离和对应遗传距离之间存在显著的正相关关系，即随着垂直海拔距离的增加，群体间的遗传距离也随之增加。Mantel 检测结果以及聚类分析将卧龙自然保护区5 个不同海拔的中国沙棘群体分为低、中、高海拔群体三组的研究结果都表明，海拔很可能是限制群体间基因交流的主要因素。 5. ISSR 分析发现同一海拔的雌雄亚群体首先聚类的研究结果表明，同一海拔的雌雄亚群体在遗传上最相似。方差分析结果表明只有3.8%的总遗传变异存在于雌雄亚群体间，这可能与雌雄植株间的交配和遗传物质的混合有关。 6. ISSR、AFLP 和RAPD 分析都表明卧龙自然保护区不同海拔的中国沙棘天然群体的遗传多样性水平较高。它们的分析结果估算得到的Nei's 平均基因多样度(h)分别为0.249、0.214 和0.170。从该结果可以看出ISSR 和AFLP 比RAPD 检测到更多的遗传多态性,这很可能是不同标记检测的基因组的位点不同所致。 7. 依据对不同标记系统的比较分析，认为ISSR、AFLP 和RAPD 三种分子标记系统都能成功地用于调查卧龙自然保护区不同海拔的中国沙棘群体的遗传变异水平及遗传变异结构，提供关于中国沙棘天然群体多态性水平和遗传变异分布的有用信息。在三者中，AFLP 具有最高效能指数和标记指数，在确定种间分类关系或鉴别个体方面是一种比较理想的标记。 Hippophae rhamnoides subsp. sinensis, a dioecious and deciduous shrub species,occupies a wide range of habitats in the Wolong Nature Reserve, Southwest China. Ourpresent study investigated the pattern of genetic variation and differentiation among fivenatural populations of H. rhamnoides subsp. sinensis, occurring along an altitudinal gradientthat varied from 1,800 to 3,400 m above sea level in the Wolong Natural Reserve, by usingISSR and AFLP markers to guide its genetic improvement and germplasm conservation. And,comparative study of ISSR, AFLP and RAPD was performed to detect their capacity toestimating the level and pattern of genetic variation occurring among the five elevationpopulations of H. rhamnoides subsp. sinensis, and to discuss their application to the study onplant genetics. The results were list following: 1. The ISSR and AFLP analysis conducted for the H. rhamnoides subsp. sinensispopulations located in the Wolong Natural Reserve of China revealed the presence of highlevels of genetic variation (h = 0.249, HT = 0.305). Besides such features as relatively widedistribution, dominantly outcrossing mating system, and effective seed dispersal by small animals and birds, it is sometimes argued that hard climatic conditions and heterogeneous habitats may also contribute to high levels of diversity. 2. Genetic diversity of H. rhamnoides subsp. sinensis populations was found to varysignificantly with changing elevation, showing a trend that mid-elevation populations (2,200m and 2,600 m) were genetically more diverse than both low-elevation (1,800 m) andhigh-elevation populations (3,000 m and 3,400 m). H. rhamnoides subsp. sinensis is thoughtto be stressed by drought and high temperature at low elevations, and by low temperature athigh elevations. The high genetic variability present in the mid-elevation populations of H.rhamnoides subsp. sinensis is assumed to be related to a greater plant density in the middlealtitudinal zone, where favorable ecological conditions permit its continuous distributioncovering the zone from 2,200 m to 2,600 m above sea level. 3. The genetic structure of H. rhamnoides subsp. sinensis revealed by ISSRs andAFLPs followed the general pattern detected in woody species with widespread distributionsand outcrossing mating systems. Such plants possess more genetic diversity withinpopulations and less variation among populations than species with other combinations oftraits. 4. In the present study, Mantel tests showed positive correlations between altitudinaldistances and genetic distances among populations or subpopulations. The observedrelationship between altitude and genetic distances, and the result of the cluster analysisincluding populations or male subpopulations and classifying the groups into three altitudeclusters suggest that altitude is a major factor that restricts gene flow between populationsand subpopulations. 5. The analysis of molecular variance showed that only 3.8% of the variability residedbetween female and male subpopulations. Such a very restricted proportion of the totalmolecular variance between female and male subpopulations is due to common sexuality andmixing of genetic material between females and males. 6. The analysis based on ISSRs, AFLPs and RAPDs all revealed relatively high levelsof genetic variation among different altitudinal populations of H. rhamnoides subsp. sinensisin Wolong Natural Reserve of China. Their estimates of mean Nei’s gene diversity is equal to0.249, 0.214 and 0.170 respectively, suggesting the higher capacity of detecting geneticvariation of ISSR and AFLP than RAPD. It might be ascribed to their distinct sensitivity todifferent type of genetic variation. 7. Based on the coparative study on ISSR, AFLP and RAPD, we drew a conclusion thatthey all successfully reveal some useful information concerning the level and pattern ofgenetic vatiation occurring among different elevation populations of H. rhamnoides subsp.sinensis. AFLP is a ideal tool to taxonomic study and individual identification for theirhighest efficiency index and marker index among the three marker systems.

中国沙棘(Hippophae rhamnoides subsp. sinensis)不同种群对干旱胁迫的响应差异与干旱诱导蛋白的分析

沙棘广泛分布于亚欧大陆的温带地区和亚洲亚热带的高海拔地区。沙棘能适应多种生态环境，能耐受多种逆境(如干旱、低温、高温和盐害等)。在中国，沙棘常常被用作植被恢复中的先锋树种而大量栽培。本文以中国沙棘为试验材料，探索沙棘适应干旱机制，以及沙棘对干旱胁迫的适应机制是否存在种群间的差异，同时试图通过分析干旱胁迫下沙棘叶片蛋白质表达变化探索沙棘适应干旱胁迫的分子机理。 对三个分别来自低海拔湿润地区、低海拔干旱地区和高海拔湿润地区的中国沙棘种群进行干旱胁迫处理。干旱胁迫能提高根冠比，比叶面积，降低平均叶面积和总生物量，提高沙棘的抗氧化性酶活性、脯氨酸含量、脱落酸(ABA)含量、降低光合作用，提高长期用水效率。实验中的这两个低海拔种群比高海拔种群抵抗干旱的能力更强,不同的种群采用了不同的策略来耐受干旱胁迫和过氧化胁迫。 在2004 年度的实验中，干旱胁迫处理下，高海拔湿润种群(道孚种群)严重失水，生长也受到更大的抑制，非气孔因素在抑制光合作用方面占支配地位，抗坏血酸含量下降，ABA和脯氨酸含量增加幅度比九寨沟种群的要高，这可能是因为道孚种群严重失水而引起的；而低海拔湿润种群(九寨沟种群)的体内水分状况几乎不受干旱的影响，生长情况也较道孚种群要好。 在2005 年度的试验中，和高海拔湿润地区种群(道孚)相比较，低海拔干旱地区种群(定西)在叶片相对水含量、根冠比、抗氧化酶活性(过氧化氢酶、抗坏血酸过氧化物酶和谷胱甘肽过氧化物酶)、保护性物质(脯氨酸，脱落酸)含量等方面都要高，光能热耗散能力也更强，而且气体交换参数(气孔扩散阻力和胞间CO2浓度等)对干旱也更不敏感。 分析了干旱胁迫下沙棘叶片蛋白质表达的变化。共发现319 个蛋白质，有4 个蛋白在干旱胁迫下消失(Putative ABCtransporter ATP-binding protein 、Hypothetical proteinXP-515578，热激蛋白Hslu219 和一个没得到鉴定的蛋白)，4 个只在干旱胁迫下出现(没命名的蛋白质产物，对甲基苯-丙酮酸双加氧酶，NTrX 和一个没得到鉴定的蛋白)，46 个蛋白质的表达丰度变化显著，包括32 个干旱负调蛋白，14 个干旱正调蛋白(3 个Rubisco 的大亚基、J-type–co-chaperone Hsc20、putative protein DSM3645-2335、putative acyl-COA 脱氢酶、nesprin-2 和两个没有得到鉴定的蛋白质)。这些蛋白质参与了氮代谢调控、抗氧化行物质的合成、脂肪酸β－氧化、核骨架构造、[Fe-S]基团组装、物质跨膜运输、细胞分裂或作为分子伴侣和蛋白质酶起作用。putative ABC transporter ATP-binging protein、NtrX、nesprin-2 和Hslu 是本试验新发现的高等植物蛋白，我们主要从它们的保守结构域或在其他生物中的同源物来猜测它们的功能。实验结果为我们研究植物抗干旱机制提供了新线索和新视野。 Seabuckthorn (Hippophae rhamnoides L.) is widly distributed throughtout the temperatureresiogn of Europe and Asia and sub-tropical plateau zone of Asia. H. rhamnoides can adapatseveral different environments, and can tolerant several envioronmental stresses (e.g, lowtemperature, high temperature, drought and salty). It has been widely used in forest restoration asthe pioneer species in China. In present study, we applied H.rhamnoides subsp. Sinensis asexperimental materials to study its drought-tolerant mechanism, and expected to findpopulational difference in drought-tolerant mechanism that may exist among populations, and tryto get some insight in drought-tolerant mechanism of it at morecular level through analyzing thechange of leaf protein expression. Three populations from high altitude wet zone, low altitude wet zone and low altitude arid znoe,respectively, were applied in our experiment, and were subjected to drought. Drought increasedthe root/shoot ratio(RS), special leaf area, long-term water use efficinency, activity of antioxidantenzymes, proline content and abscisic acid (ABA) content, declined the net photosynthesis rate(A), average leaf area (ALA), total biomass (TB). Both two low altitude populations were moredrought-tolerant than the high altitude population, and different population applied differentstratedgies to tolerant oxidant stress and drought stress. The results of the exprement in 2004 showed that Daofu population was more drought-sensitivethan Jiuzhai population. Under drought conditions, leaf relative water content (RWC) greatlydecreased in Daofu population, but not in Jiuzhai population. The large loss of water in Daofupopulation resulted in a limitation on A mainly caused by non-stomatal factors, severer suppression in growth rate and a significant reduction in ascorbic acid (AsA) content, comparedwith Jiuzhai population. The greater increase in content of ABA and proline in Daofu populationmay be also induced by large loss in water, so that enable plants to cope with sever drought. In the exprement of 2005, drought significantly increased RS, activities of catalase (CAT),peroxidase (POD), glutathione peroxidase (GPX) and ascorbate peroxidase (APX), and alsosignificantly increased ABA and proline contents. On the other hand, compared with Daofupopulation, drought induced larger RS and activities of CAT, GPX and APX, and higher ABAcontent in Dingxi population, whereas gas exchange traits, e.g., stomatal limitation value (LS) andintercellular CO2 concentration (Ci), were less responsive to drought in Dingxi population thanthose in Daofu population. All these factors enable Dingxi population to tolerant drought betterthan Daofu population. The leaf protein profile of seabuchthorn subjected to drought was analyzed. Altogether 319proteins were detected in well-watered sample, four proteins disappeard by drought (putativeABCtransporter ATP-binding protein, hypothetical protein XP-515578, Hslu219and aunidentified protein), four only appeared under drought (a probable nitrogen regulation protein(NtrX), a 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase , an unnamed protein product and an identified protein), 32 drought down-regulated proteins, and 14 drought up-regulated proteins (nine wereidentified: three large subunits of Rubisco, a hypothetical protein DSM3645-23351, a putativeacyl-COA dehydrogenase, a nesprin-2, a J-type-co-chaperone HSC20 and two unmatchedproteins). These proteins may involve in β-oxidation, cross-membrane transport, cell division,cytoskeleton stabilization, iron-sulfur cluster assembly, nitrogen metabolism regulation andantioxidant substance biosynthesis or function as molecular chaperone or protease. Four proteins(a putative ABC transporter ATP-binging protein, NtrX, nesprin-2, Hslu) were new found in highplants, and their functions were estimated from their conserved domain or their homologues inother organism. Our results provided new clue and new insight for us to study thedrought-tolerant mechanism in plants.

中国沙棘(Hippophae rhamnoides subsp. sinensis)天然群体的遗传变异分析

近十年，植物群体遗传学的研究飞速发展，然而与海拔相关的植物群体遗传结构和遗传变异研究却相对较少。到目前为止，还不清楚遗传变异与海拔之间是否有一个通用的格局。在山区，各种生态因子，如温度、降水、降雪、紫外线辐射强度以及土壤成分都随海拔梯度急剧变化，造成了即使在一个小的空间区域，植被类型变化显著，这种高山环境的异质性和复杂性为我们研究植物群体遗传结构和分化提供了方便。沙棘(Hippophea)属于胡颓子科(Elaeagnaceae)为多年生落叶灌木或乔木，雌雄异株，天然种群分布极为广泛。中国沙棘(H. rhamnoides subsp. sinensis)是沙棘属植物中分布较广的一个亚种，种内形态变异非常丰富，加之其具有独特的繁育系统和广泛的生态地理分布，是研究沙棘属植物遗传变异和系统分化的理想材料。本文从1,800 m 到3,400 m 分5 个海拔梯度进行取样，用RAPD 和cpSSR 分子标记研究了卧龙自然保护区中国沙棘天然群体的遗传结构和遗传变异。5 个取样群体依次标记为A、B、C、D 和E，它们分别代表分布在海拔1,800，2,200，2,600，3,000 和3,400 m 的5 个天然群体。RAPD实验用11 条寡核苷酸引物，扩增得到151 个重复性好的位点，其中143 个多态位点，多态率达94.7%。在5 个沙棘群体中，总遗传多样性值(HT)为0.289，B群体内的遗传多样性值为0.315，这完全符合沙棘这种多年生、远交的木本植物具有高遗传变异的特性。5 个群体内遗传多样性随海拔升高呈低－高－低变异趋势，在2,200 m海拔处的B群体遗传多样性达最大值0.315，3,400 m海拔处的E群体则表现最小仅0.098。5 个群体间的遗传分化值GST＝0.406，也即是说有40.6%的遗传变异存在于群体间，1,800 m海拔处的A群体与其它群体的明显分离是造成群体间遗传分化大的原因。UPGMA聚类图和PCoA散点图进一步确证了5 个群体间的关系和所有个体间的关系。最后，经过Mantel检测，遗传距离与海拔表现了明显的相关性(r = 0.646, P = 0.011)。cpSSR 实验中，经过对24 对cpSSR 通用引物筛选，11 对引物能扩增出特异性条带，只有2 对引物(ccmp2 和ARCP4)呈现多态性。4 个等位基因共组合出4 种单倍型，单倍型Ⅰ出现在A 群体的所有个体和B 群体的8 个个体中，C、D、E 三个群体均不含有，而单倍型Ⅱ出现在C、D、E 三个群体的所有个体及B 群体的18 个个体中，A 群体不含有。另外两种单倍型Ⅲ和Ⅳ为稀有类型，仅B 群体中的4 个个体拥有。这种单倍型分布模式和TFPGA 群体聚类图揭示了，C、D、E 群体可能来源于同一祖先种，而A 群体却是由另一祖先种发展起来的，B 群体则兼具了这两种起源种的信息，这可能是因为在历史上的某一时期，在中国沙棘群体高山分化的过程中，B 群体处某个或者某些个体发生了基因突变，具备了适应高海拔环境的能力，产生了高海拔沙棘群体的祖先种。 In recent ten years, studies about population genetics of plants developed rapidly,whereas their genetic structure and genetic variation along altitudinal gradients have beenstudied relatively little. So far, it is uncleared whether there is a common pattern betweengenetic variation and altitudinal gradients. In the mountain environments, importantecological factors, e.g., temperature, rainfall, snowfall, ultraviolet radiation and soil substratesetc., change rapidly with altitudes, which cause the vegetation distribution varying typically,even on a small spatial scale. The mountain environments, which are heterogeneous andcomplex, facilitate and offer a good opportunity to characterize population genetic structureand population differentiation.The species of the genus Hippophae L. (Elaeagnaceae) are perennial deciduous shrubs ortrees, which are dioecious, wind-pollinated pioneer plants. The natural genus has a widedistribution extending from Northern Europe through Central Europe and Central Asia toChina. According to the latest taxonomy, the genus Hippophae is divided into six species and12 subspecies. The subspecies H. rhamnoides ssp. sinensis shows significant morphologicalvariations, large geographic range and dominantly outcrossing mating system. Thesecharacteristics of the subspecies are favourable to elucidate genetic variation and systemevolution. To estimate genetic variation and genetic structure of H. rhamnoides ssp. sinensisat different altitudes, we surveyed five natural populations in the Wolong Natural Reserve at altitudes ranging from 1,800 to 3,400 m above sea level (a.s.l.) using random amplifiedpolymorphic DNA markers (RAPDs) and cpSSR molecular methods. The five populations A,B, C, D, and E correspond to the altitudes 1,800, 2,200, 2,600, 3,000 and 3,400 m,respectively.Based on 11 decamer primers, a total of 151 reproducible DNA loci were yielded, ofwhich 143 were polymorphic and the percentage of polymorphic loci equaled 94.7%. Amongthe five populations investigated, the total gene diversity (HT) and gene diversity within population B equaled 0.289 and 0.315, respectively, which are modest for a subspecies of H.rhamnoides, which is an outcrossing, long-lived, woody plant. The amount of geneticvariation within populations varied from 0.098 within population E (3,400 m a.s.l.) to 0.315within population B (2,200 m a.s.l.). The coefficient of gene differentiation (GST) amongpopulations equaled 0.406 and revealed that 40.6% of the genetic variance existed amongpopulations and 59.4% within populations. The population A (1,800 m a.s.l.) differed greatlyfrom the other four populations, which contributes to high genetic differentiation. A UPGMAcluster analysis and principal coordinate analyses based on Nei's genetic distances furthercorroborated the relationships among the five populations and all the sampling individuals,respectively. Mantel tests detected a significant correlation between genetic distances andaltitudinal gradients (r = 0.646, P = 0.011).Eleven of the original 24 cpSSR primer pairs tested produced good PCR products, onlytwo (ccmp2 and ARCP4) of which were polymorphic. Four total length variants (alleles) werecombined resulting in 4 haplotypes. The haplotype was present in all individuals of Ⅰpopulation A and 8 individuals of populations B, the other three populations (C, D and Epopulations) did not share. The haplotype was present in all individuals of populations C, D Ⅱand E and 18 individuals of populations B, population A did not share. The other twohaplotypes and were rare haplotypes, which were only shared in 4 individuals of Ⅲ Ⅳpopulation B. The distribution of haplotypes and TFPGA population clustering map showedthat the populations C, D and E might be origined from one ancestor seed and population Amight be from another, whereas population B owned information of the two ancestor seeds. Itwas because that gene mutation within some individual or seed in the location of population Bwas likely to happen in the history of H. rhamnoides, which was the original ancestor of thehigh-altitude populations.

Construction and analysis of an experimental Streptococcus iniae DNA vaccine

Streptococcus iniae is a severe aquaculture pathogen that can also infect humans and animal. A putative secretory antigen, Slat 0, was identified from a pathogenic S. iniae strain by in vivo-induced antigen technology. Using turbot as an animal model, the immunoprotective effect of Sia10 was examined as a DNA vaccine in the form of plasmid pSia10, which expresses sia10 under the cytomegalovirus immediate-early promoter. In fish vaccinated with pSia10, transcription of sia10 was detected in muscle, liver, spleen, and kidney at 7, 14, 21, 28, 35, 42, and 49 days post-vaccination. In addition, production of Sia10 protein was also detected in the muscle tissues of pSia10-vaccinated fish. Fish vaccinated with pSia10 exhibited a relative percent survival (RPS) of 73.9% and 92.3%, respectively, when challenged with high and low doses (producing a cumulative mortality of 92% and 52%, respectively, in the control groups) of S. iniae. Immunological and transcriptional analyses showed that vaccination with pSia10(i) induced much stronger chemiluminescence response and significantly higher levels of nitric oxide production and acid phosphatase activity in head kidney macrophages; (ii) caused the production of specific serum antibodies, which afforded apparent immunoprotection when transferred passively into naive fish; and (iii) upregulated the expression of the genes encoding proteins that are possibly involved in both innate and adaptive immune responses. Taken together, these results indicated that pSia10 is an effective vaccine candidate and may be used in the control of S. iniae infection in aquaculture. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.

黄芪复合体Astragalus penduliflorus Lam. complex (Leguminosae)的物种生物学研究

本文对黄芪复合体（Astragalus penduliflorus）复合体进行了物种生物学研究，主要内容包括如下： 1、形态学与物种生物学证据支持目前承认的黄芪复合体5种4变种应分为1种5亚种（其中新亚种一个）。它们是A. penduliflorus subsp. penduliflorus, A. penduliflorus subsp. seiceocanus, A. penduliflorus subsp. mongholicus, A. penduliflorus subsp. qinhaiensis（新亚种）和A. penduliflorus subsp. pallidipurpureus等5个分类实体。 2、讨论了分类群间的形态演化关系。黄芪复合体的进化趋势可能为：A. penduliflorus subsp. pallidipurpurous A. penduliflorus subsp. Qinhaiensis → A. penduliflorus subsp. Mongholius → A. penduliflorus subsp. Sericeocanus → A. penduliflorus subsp. pendulifloras。 3、分析了黄芪复合体3个亚种10个居群的染色体核型，它们的染色体2n=16，各居群间的核型呈现连续的变异式样。 4、分析了黄芪复合体5个亚种13个居群和两个近缘种的种子蛋白，并进行了聚类分析，认为种子蛋白性状在黄芪复合体的居群内比较稳定，且同一居群内的不同个体间无明显差异。同时，种子蛋白分析说明了复合体内居群也呈现连续变异。 5、应用最大同步分支分类法及最小平行进化分支分类法分析了黄芪复合体的谱系分支发生，确认复黄芪复合体为一自然复合种是比较客观的。

牡丹复合体的研究

牡丹复合体属芍药属(Paconia)牡丹组(Sect. Moutan)．原有6个种名，包括花壬 牡丹、名贵野生花卉紫斑牡丹，著名中药牡丹皮原植物，野生种类为我国特有，仅分 布在以秦岭为中心的较小区域．本研究从山西、陕西、河南、湖北、甘肃共采集14 个居群（包括复合体不同类型）．通过野外居群调查、样方研究，移栽实验，以及细 胞学观察、孢粉学观察分析、种子蛋白和DNA水平多样性的探索性的工作，并结合 聚类分析方法，对牡丹复合体进行了分类学和保护生物学两方面的研究，主要结论 为： 1．本复合体为多年生木本植物，生长缓慢，在天然状况下，从种子播种到开花结实长达7年．枝条通常具隔年开花习性．严格单花顶生，花期短(5-10天)．雄蕊先熟，以异花传粉为主（主要传粉者有甲虫和野蜂）．自交亲和，甲虫在传粉过程中常常破坏心皮和胚珠．胚珠败育比例很高，紫斑牡丹50%．其它类群达90%． 2．种子生物学特性研究，发现本复合体种子属正统种子，但种子衰变快．种子萌发时间长，一般的化学及物理处理对种子萌发无明显促进作用，种子具上胚轴休眠特性．打破休眠需要两个条件：一是胚根长足3 cm．二是10℃左右的低温或GA3处理，野生紫斑牡丹种子较大，复合体其它野生类群种子较小．野生牡丹的种子活力相当低，萌发时间更长． 3．样方的调查统计表明，稷山和永济两地区的矮牡丹株数一龄级分布规律是2—5年生个体最多，随年龄级的增加，个体数目减少．居群呈增长趋势．紫斑牡丹株数一龄级分布规律是青壮年时期个体数目多，幼年时间和老年时期个体数目少，居群呈衰退的趋势，这与其本身繁殖方式和人为破坏程度相关． 4．对13个居群花粉扫描电镜观察表明，本复合体紫斑牡丹(P. rockii)为粗网纹，网眼大，其它类群为细网纹、网眼小． 5．通过18个居群的核型分析并结合前人工作，发现本复合体染色体数目稳定2n =10．核型差别不大，野生类群和栽培品种间有一定分化，但总体上核型多样性比较贫乏．通过8个居群C带研究，发现带纹很少，但多样性很丰富．8个居群表现出7种带型． 6．种子蛋白和DNA水平多样性的初步研究，发现复合体具有较丰富的多样性．但多样性的分布对类群的划分帮助不大，有待进一步研究． 7．通过形态性状分析发现产自各地区矮牡丹、河南粉花类型、神农架红花类型具根出条现象，并以此为主要繁殖方式，紫斑牡丹无此现象．神农架红花类型植株矮小，复合体其它类群较高．产自各地区的矮牡丹和神农架红花类型为二回三出复叶．小叶数目多为9．矮牡丹顶生小叶具浅裂、中裂或深裂，裂片具齿，神农架红花类型顶生小叶仅具浅裂或齿（全缘）．河南粉花类型为二回羽状复叶．小叶数目12-15．紫斑类型叶为二回或三回羽状复叶、小叶数目15-40．小叶分裂方式分两种类型，秦岭西部居群以浅裂、全缘为主，东部居群以中裂或深裂为主，裂片具齿．神农架红花类型花为平展型、较小，其它地区花杯状、较大．花盘有二种类型．紫斑类群花盘黄色或白色．1／2-4／5包被心皮，心皮被稀疏长柔毛，其它类群花盘紫红色，全包心皮，心皮密被短硬毛．根据形态性状分析．并结合细胞学、孢粉学和地理分布研究，对复合体做如下处理：(l)把神农架红花类型做为新种处理P．quii Y.L．Pei et Hong．(2)保留P.rockii(S.G.Haw et L.A. Lanener)T.Hong ct J.J.Li和P.ostii T.Hong et J．X. Zhang．前者进一步分成二亚种：subsp. rockii和subsp. lanceolata Y.L．Pei et Hong（新亚种）．后者包括河南粉花类型，中药丹皮原植物．(3)保留P．suffruticosa Andr.种内分二亚种：subsp. suffruticosa和subsp. spontanea (Rehd．)S．G. Haw et L．A, Lauener. (4)废弃P.papaveracea Andr.和P.jishanensis T.Hong et W.Z.Zhao (5)P．yanancnsis T．Hong et M.R．Li作为存疑种处理． 8．通过上述研究对野生牡丹濒危原因加以分析，认为致濒原因主要是人为干扰和种子萌发和传粉特点等生物学特性造成，但以前者为主，建议应广泛开展各个层次多样性研究，为生物多样性保护利用奠定基础。

中国三种野生稻的遗传变异与保护生物学研究

稻属(OryzaL．)隶属禾本科(Poaceae)之稻族(OryzeaeDUmort.)，广布于全球热带与亚热带地区。目前认为该属约含20个野生种和2个栽培种，中国产4个种。亚洲栽培稻(O. sativaL．)是世界上最重要的粮食作物之一，而在中国则为第一粮食作物。在稻种基因库中，发掘野生稻中丰富的遗传多样性是解决当今人口与粮食矛盾的必由之路。因此，保护野生稻的遗传多样性举世瞩目。针对热带与亚热带地区的环境恶化而导致野生稻居群的大量绝灭与急剧萎缩的状况，制订有效的策略，最大限度地保护野生稻的遗传多样性已迫在眉睫。然而，目前对野生稻种内遗传多样性的知识十分贫乏，缺乏制订保护策略的科学基础。这一问题在中国尤为突出。本文基于1994-1995年对中国三种野生稻濒危状况的调查结果，利用等位酶分析对普通野生稻26个居群，药用野生稻8个居群和疣粒野生稻l7个居群进行了遗传多样性的研究，并重点对目前育种价值最大而濒危程度最高的普通野生稻从五个方面作了进一步的探讨。最后根据遗传多样性的研究结果讨论了它们的濒危原因，并提出了初步的保护策略。主要结果如下： 一．普通野生稻D．rufipogon Griff. 在中国的三种野生稻中，普通野生稻的遗传多样性水平最高(A=1.33，P= 0.227，Ho=0.033和He=_0.068)，遗传分化水平较低(Fst=0,310)。广西与广东的居群较其它地区的居群具有较丰富的遗传变异。因此，华南可能是中国普通野生稻的遗传多样性中心;云南现存的所有三个居群的遗传多样性水平偏低(A=1.10.p=0.148，Ho=0.007和He=0.079)，与该地区栽培稻丰富的遗传多样性形成鲜明对照，普通野生稻居群间的遗传一致度与地理距离无明显相关。 1．通过14个中央居群与5个边缘居群的对比研究表明了边缘居群的遗传结构明显不同于中央居群：其遗传多样性水平与遗传分化均低予中央居群，杂合子比中央居群更为不足。而且，从中央居群到边缘居群，位点的多态性逐渐丧失，遗传多样性水平递减，一些多态位点的等位基因频率逐渐地发生变化。 2. 通过7个受栽培稻基因渗入的居群与5个隔离较好居群的对比研究表明，被渗入居群虽然在形态上表现出复杂的变异式样，但遗传多样性水平并无相应的增高。栽培稻基因流对野生居群遗传结构的影响可能主要是遗传同化，即阻止其居群内与居群间的遗传分化。 3. 通过对2个低纬度居群与2个北缘居群两个生活史阶段的遗传多样性研究表明繁育系统是影响普通野生稻居群遗传结构的因素之一。在低纬度居群中种子阶段的遗传变异高于植株阶段，在高纬度居群中则相反。 4．通过对北缘居群(江西东乡)1980年，1985年和1994年的居群遗传结构的研究，发现该居群的遗传结构逐渐在发生变化，表现为遗传多样性水平不断下降，居群越来越偏移哈迪一温伯格平衡和杂合子变得越来越缺乏。 5．通过对一个典型的普通野生稻居群（元江居群）的居群内遗传结构的研究，表明遗传变异在3个亚居群间分布不均衡，基因型里聚集分布，使得亚居群间有一定的遗传分化。导致其居群遗传结构的亚划分的主要原因可能是有限的基因流(Nm=0.964subsp.granulata Nees et Arn.ex Watt. 疣粒野生稻的遗传多样性水平(A=1.Ot5，p—0.0633，Ho- 0.022和He=O.O16)在三种野生稻中最低，但居群遗传分化却很高(FsT=0.859)。海南的遗传多样性水平与云南差别不大。剧烈的遗传分化不仅发生在海南与云南之间，而且还发生在地区内，甚至在很小地区内的居群阍。对每个地区来说，居群间的遗传一致度与地理距离明显相关，符合“隔离一距离”模型。该物种是克隆植物，遗传变异贫乏但居群遗传分化剧烈是这类植物的特征。 四. 对保护中国野生稻遗传资源的启示 中国的三种野生稻是居群水平上而非物种水平上的的濒危。人类的剧烈干拢和生境遭受破塥是导致它们濒危的主要原因。对普通野生稻和药用野生稻来说，人为的干扰导致了它们现存的居群变小且相互隔离，居群间的基因流受阻，遗传漂变的作用在小群体中显得尤为突出，并与严重的近交相交织，导致遗传多样性大量丧失，居群的遗传结构也进一步改变，从而产生真正遗传学上的濒危，甚至灭绝。对于普通野生稻的大多数居群来说，栽培稻频繁的基因流带来的遗传同化，也会直接或间接地引起濒危甚至消亡。 鉴于普通野生稻有69.0%的遗传多样性存在于居群内，收集种质资源时应在遗传变异丰富的居群中，特别在其遗传多样性中心的居群中取较多数量的个体，还应在不同的地理区域选择2～3个遗传变异丰富、彼此遗传差异大的居群作为代表，捕获存在于居群间的遗传变异。原位保护点的设置应优先考虑以下类型的居群：a．与栽培稻基因流隔离好的居群;b．边缘居群;c．严重受威胁的居群;原位保护区应在其遗传多样性中心设立，选择有数个相邻的较大居群。 鉴于药用野生稻有21.2%的遗传多样性存在于居群内，在收集种质资源时原则上应选择较多的居群，而在每个居群中取较少的个体。海南与大陆居群间的遗传差异较大，故两地的居群都必须收集;药用野生稻的居群通常较小，建议设立原位保护点即可。海南与大陆均须设立保护点，而且在每个地区内应保护尽可能多的居群。对地区间或地区内的居群间进行人工移植，促进基因流，对增强各居群的适应能力会有裨益。 鉴于仅有14.1%的遗传变异存在予疣粒野生稻的居群内，取样的原则是在云南和海南均取尽可能多的居群，而对每个居群取少数个体即可;该种的居群有时较大，其居群内往往有一定的遗传分化，故收集遗传资源时应按亚居群取样;建议在云南与海南各设置2～3个原位保护区，其中可优先考虑我国分布面积最大的云南思茅地区的居群。

绵枣（Scilla sinensis Merr.）多倍体复合体（广义百合科）的物种生物学研究

本文采用物种生物学的方法分析了绵枣[Scilla sinensis (Lour.) Merr.]多倍体复合体细胞地理、形态、生态适应和发育节律的变异。此外，还对AA细胞型居群进行了等位酶分析和杂交实验。结果如下： 1. 细胞学检查秀自中国境内45个居群，检出AA、AB、BB、AAA、BBB和AABB 6个细胞型。多数居群由1种细胞型组成。AA几乎占据着该复合体在中国的整个分布区。BB仅局限于华中和华东地区。AABB分布于华中和华东地区的北侧、东北地区的东南部及台湾岛。45个居的细胞型组成以细胞地理分布图表示。总结前人与我们的工作，该复合体中已发现12个整倍体细胞型（AA、AB、BB、AAA、ABB、BBB、AAAA、AABB、ABBB、BBBB、AABBB和AAABBB）和各种基于多倍体的非整倍体。其基本细胞型为AA、BB和AABB。AA分布于除日本和大陆上BB分布区中心外该复合体的整个分布区。BB分布中国华东和华中地区、朝鲜的济州岛和日本。AABB分布日本、朝鲜和中国东北地区的东南部及华中、华东地区的东侧。另外，BB居群染色体数量最多，AABB次之，而AA最低。 2. 野外调查和栽培实验表明AA细胞型在中国东部和西部地区间存在形态和生态分化，东部居群形态变异较小，其共同特征是纺锤形鳞茎，红褐色;根茎短柱状;叶多灰绿色，蜡质明显，斜升;花葶较强壮而直立;花紫红色;子房每室1胚珠。西部为AA细胞型的现代变异中心，居群间形态变异大，区别于东部居群的特点是鳞茎纺锤形或近球形，根茎短柱状或盘状，叶鲜绿色，蜡质不明显，平卧地面;花葶1－4枝，直立，多花葶时斜升;花白色或淡红色，子房每室胚珠1 ～ 2枚。AA和BB细胞型是向着适于不同地理区的环境发展，因而具有不同的形态和生物学特性的两个类型。BB鳞茎近球形，黄褐色，根茎不明显，为盘状;叶墨绿色，柔软而平卧地面，是适于阴湿的林下环境的结果。春季萌发较早，约在3月初，其夏季休眠特性刚好可渡过华中地区东部夏季的高温多雨，待秋季温度下降时开花结实。而AA划适应了光照较强而干旱的山坡草地灌丛的类型。其发育节律变异较大，但萌动较BB晚，无夏季休眠。AABB细胞型的形态介于两祖先二倍体之间，没有形成独特的生态适应和发育节律。 3. 对AA细胞型的等位酶分析表明，该种的居群表现出较高的遗传变异（A = 2.0, P = 58.6%, H_o = 0.172 和 H_e = 0.185）。居群间存在较明显的分化(F_(ST) = 0.314)。东西两地区间也存在遗传分化。 4. AA居群间多数组合的F_1都低于对照的花粉育性和结实率。尤其是东部和西部居群间组合的F_1花粉育性和结实率极低，几近不育。如果仅仅考虑该复合体的形态变异，它只能作为一个形态复杂多变的种，Scilla sinensis (Lour) Merr.。可是如此处理就掩盖了其细胞型间清晰的进化关系。为弥补这一缺陷，当研究细胞型间的进化关系时，可采用生物学和概念。AA细胞型为S. sinensis (Lour.) Merr.， 可分两亚种：subsp. sinensis 和 subsp. alboviridis (Hand.-Mazz.) K. Y. Ding。BB细胞型为S. thunbergii Miyabe et Kudo。而ABB及含有A和B染色体组的多倍体作为杂交种S. x sino-japonica K.Y.Ding。两个二倍体种形态界限很清楚，但AABB的存在湮灭了两者的间断。

中国堇菜属的分类修订

堇菜科堇菜属全世界约有525–600种，分布于除南极洲之外的广大地区，大部分种类分布于北温带地区和南美洲安第斯山脉地区。我国是堇菜属的主要物种多样性中心之一，《中国植物志》(51卷)记载了111种，另外有58个基于中国产的模式标本描述的学名在该著作中没有处理。由于本属形态变异复杂，分类相当困难，我国该属植物同物异名、名实不符的问题相当常见，《中国植物志》遗漏种类过多，因此需要全面修订。 通过文献查阅、标本研究、野外考察和部分种类的移栽实验，本文对中国堇菜属进行了力所能及的分类修订。描述新种和新变种9个(Viola dimorphophylla、 V. muliensis、 V. bulbosa var. oblonga、 V. gongshanensis、 V. guangxiensis、 V. hui、V. magnifica var. qianshanensis、 V. miaolingensis和V. nitida;其中V. dimorphophylla为全世界堇菜属中发现的唯一具轮生叶的种类)，做出新组合6个(V. biflora var. rockiana、 V. dissecta var. incisa、 V. prionantha var. taishanensis、 V. philippica var. stenocentra、V. kosanensis subsp. pendulicarpa、V. kosanensis subsp. serrula)，补充记载11个以前发表而后来未再在我国有 关分类学著作中提及的种(V. belophylla、V. yunnanfuensis、V. tienschiensis、 V. duclouxii、 V. fargesii、 V. hondoensis、V. kosanensis、V. japonica、 V. striatella、 V. kwangtungensis 和 V. perpusilla)， 确认我国没有V. yezoensis和V. faurieana的分布，发现中国分布新记录种和变种各1个(V. violacea和V. tokubuchiana var. takedana)，将85个学名降为异名，另外对58个《中国植物志》(51卷)中没有处理的学名全部进行了分类处理。我们的修订结果承认中国有堇菜属植物101种、3亚种和13变种，1种因未见模式标本暂存疑。本文对所有种给出了分种检索表、形态描述和标本引证，对大多数种进行了分类学评论和绘出了地理分布图以及形态图解。此外, 本文指定了33个名称的后选模式。 根据形态学、地理分布和细胞学证据，本文将匍匐堇菜组和蔓茎堇菜组予以归并;根据形态特征，在合生托叶组内建立了两个新系，即圆叶堇菜系和鳞茎堇菜系;我们认为前人在二裂花柱组内单纯强调距的长短而完全忽略其他性状划分的两个亚组——长距堇菜亚组和短距堇菜亚组——不合理，故结合根状茎、根、地下匍匐茎和花冠的有关性状对本组重新进行了亚组划分，合并长距堇菜亚组和短距堇菜亚组，建立一个新的亚组，即灰叶堇菜亚组。此外, 本文对3种(V. magnifica、V. henryi和V. pendulicarpa)的系统位置进行了调整。 本文对我国堇菜属34种共42个居群进行了染色体记数，其中20种的数目为首次报道。我们发现合生托叶组的染色体基数应该为x=6,而不是先前认为的x=12, 合生托叶组的大部分种类为多倍体，其中具有种内多倍性的种类具有很强的杂草习性。蔓茎堇菜组的多数种类的染色体数目为2n=24, 与合生托叶组很相似，另外这两个组具有相似的形态和地理分布特征，我们认为蔓茎堇菜组与合生托叶组的亲缘关系较紧密。

丁香属（Syringa L.）的分类学修订

丁香属隶属于木犀科，分布于东南欧和东亚至喜马拉雅地区，我国是丁香属的现代分布中心。《中国植物志》（61卷，1992）记录了我国野生丁香种类16种;《Flora of China》（15卷，1996）记录了中国原产丁香种类16种，并认为全世界大约有20种。丁香属属下分类等级划分分歧较大，很多种的划分也存在争议。花叶丁香、四川丁香等种类是根据栽培植物描述的，没有指定模式标本，给分类处理带来了一定困难。另外，丁香属很多分类群的性状变异非常复杂，仅根据有限的标本很难做出合理的分类处理。本研究通过广泛查阅文献和标本，同时进行野外居群取样和性状观察，对各类群的性状在居群内和居群间的变异进行统计学分析，判断其分类价值，并运用多变量分析的方法，为各类群的合理划分提供依据。结合性状分析和地理分布等证据，做出分类处理。 作者查阅了国内外16个标本馆的近2000份标本，其中模式标本约70份。对我国12个省市的40余个居群进行了取样和观察，采集标本500余份，涉及了《中国植物志》61卷收录的除了藏南丁香以外的所有类群。通过对9个复合体的40余个性状在居群内和居群间的变异进行统计分析，发现叶片类型、叶柄长度、花序着生类型、花冠大小、花丝长度、花药颜色在不同类群间差异明显，可以用作划分种的依据;叶片形状、叶片毛被、花序轴毛被、花冠管形状等性状在有些复合体内的居群间呈现连续的变异，只能用作种下等级（亚种）的划分;叶片大小、花序轴形状、花药着生在花冠的位置、蒴果是否被皮孔等性状在不同复合体的居群间呈现间断或连续的变异，视不同情况可以用作种间或种下等级的划分依据，或作种内变异处理;而叶脉、花色、花萼齿裂、花冠裂片形状等性状在居群间差异不大，不适合用作分类依据。 在性状分析和多变量分析的基础上，本文将丁香属划分为2组2系12种13亚种，其中短花冠管组有1种3亚种;长花冠管组的顶生花序系有5种5亚种，侧生花序系有6种5亚种，并指定了各组和系的模式种;编制了属下各组、系、种和亚种划分的检索表，对12种13亚种进行了形态描述、标本引证，给出了地理分布图和生境，并提出了分类处理依据。文中对巧玲花、皱叶丁香、红丁香和云南丁香等复合体内的一些分类群进行了归并，做出4个新组合：S. pubescens ‘Meyer’、S. villosa subsp. wolfii、S. yunnanensis subsp. sweginzowii和S. yunnanensis subsp. tomentella，处理了11个新异名（S. fauriei H. Lév.、S. julianae C. K. Schneid.、S. meyeri var. spontanea M. C. Chang、S. pinetorum W. W. Sm.、S. wardii W. W. Sm.、S. oblata var. donaldii R. B. Clark et J. L. Fiala、S. afghanica C. K. Schneid.、S. protolaciniata P. S. Green et M. C. Chang、S. tibetica P. Y. Bai、S. reflexa C. K. Schneid. 、S. wilsonii C. K. Schneid.）。作者指定了3种4亚种(S. reticulata subsp. reticulata、 S. reticulata subsp. amurensis、S. pubescens subsp. microphylla、S. oblata subsp. dilatata的后选模式，并对其它10个名称指定了后选模式。文中还提出了分类处理原则，对我国丁 香属的分布及各地方植物志的记载进行了评述，并对丁香属的分布格局提出了作者的看法。 作者还对13个分类群的16号材料进行了染色体观察，发现除了毛丁香有染色体2n=48外，其它均为2n=46，其中朝阳丁香的染色体数目为首次报道。对小叶巧玲花不同异名（包括小叶蓝丁香、小叶巧玲花与小叶蓝丁香的杂交种）的材料进行染色体观察时，发现它们之间差异很小，进一步佐证了作者将其合并的合理性。另外野生的花叶丁香（华丁香）与栽培的花叶丁香在染色体数目上也无差异，支持了作者认为二者为同物异名的观点。

蕨属的系统发育及谱系地理学研究

蕨属（Pteridium Gled. ex Scop）分布范围极广，几乎遍布于全世界。关于此属的属下分类一直争论不休，主要是因为此属的分布广，形态变异比较大，变异类型之间形态差异不显著，缺乏明确的鉴别性状，或者变异类型之间存在过渡。 本研究利用叶绿体rps4-trnS DNA序列和trnS-G DNA序列构建了世界不同地区蕨属植物的系统关系及中国区域蕨属植物的系统关系，同时构建了世界不同地区蕨属植物的单倍型关系。我们发现，（1）南美洲和澳洲的蕨属植物分化最早;（2）北美洲的蕨属植物遗传变异最丰富，有多条相互独立的进化线（evolutionary lineages）;（3）欧亚大陆和非洲的蕨属植物都与北美洲具有密切关系;（4）大洋洲的蕨属植物同时受南美洲和亚洲蕨属植物的影响;（5）东亚的蕨属植物直接受北美洲蕨属植物的影响，与欧洲和非洲没有直接的关系;（6）非洲和欧洲的蕨属植物关系密切，有着相同的起源。 根据不同地点的蕨属植物的系统关系和单倍型Network关系，我们认为，蕨属植物起源于南美洲，而后向北美洲和澳洲扩散。在北美洲东部和东南部蕨属植物得到繁荣并分别向三个方向扩散与分化。第一个方向是朝北美西部扩散，第二个方向是两次独立扩散到亚洲，第三个方向是扩散到非洲，进而由非洲向欧洲扩散。 根据叶绿体基因所揭示的世界不同地区蕨属植物的发生和发展规律结合前人的研究，我们认为蕨属包含四个物种。Pteridium aquilinum (L.) Kuhn，分布于北美洲、亚洲、非洲和欧洲。该种分布广泛，存在一定的地理分化，可进一步划分8个亚种。Pteridium esculentum (G. Forst.) Cokayne，分布于南美洲，并扩散到澳大利亚，甚至东南亚国家。Pteridium caudatum (L.) Maxon，分布于中美洲和南美洲，是个异源四倍体。Pteridium semihastatum (Wall. ex Ag.) S.B.Andrews，分布于澳洲和东南亚，是个异源四倍体。 通过分子数据和形态分析相结合，作者认为中国蕨属包括两个亚种，即蕨[Pteridium aquilinum (L.) Kuhn subsp.japonicum (Nakai) Á.Löve & D.Löve]和毛轴蕨[Pteridium aquilinum (L.) Kuhn subsp. revolutum (Bl.) X. Q. Chen, stat. nov.]。作者认为，《中国植物志》中记载的食蕨，特有种云南蕨、糙轴蕨、镰羽蕨和长羽蕨并不存在或只是蕨或毛轴蕨的变形，或者毛轴蕨与蕨的杂交个体。 为了今后更进一步研究蕨属植物的系统与进化关系、居群的遗传结构等问题，作者还分离了8个具有多态性的微卫星位点，探讨了微卫星引物开发设计过程中如何提高效率等问题。

秦岭苔类植物的研究和中国剪叶苔属（Herbertus S. Gray）的分类学修订

本论文包括两部分的内容，第一部分是秦岭苔类植物的区系研究，第二部分是中国剪叶苔属Herbertus的分类学修订。 秦岭位于我国的中部，东经104º30´～112º52´，北纬32º50´～34º45´N，约76 500 km2。它主要位于陕西省的南部地区，并包括了河南、甘肃和湖北的部分县、市。秦岭的最高峰是太白山，海拔3 767米。秦岭是长江和黄河的分水岭，也是我国温带和亚热带气候的过渡地带。 本研究包含了对自19世纪开始对秦岭苔藓植物的主要采集活动的回顾，和截止2008年以来对秦岭苔类和角苔类植物报道的总结和分析，且首次给出了一份秦岭地区详细的苔类植物的名录，并包括了各个种在秦岭地区的详细分布。根据目前的研究，现已知秦岭的苔类植物有226种（包括种下单位，以下同），其中角苔纲1科3属6种，苔纲30科59属220种；提出了1个新异名：Radula constricta Steph.被处理为Radula lindenbergiana Gottsche var. atypa Massalongo的异名；并提出了1个新组合Metzgeria pubescens var. kinabaluensis (Kuwah) F.X. Li & Y. Jia；发现秦岭新分布的苔类有78种。根据种数，秦岭地区苔类的优势科为光萼苔科（34种），其次为耳叶苔科（23种），裂叶苔科（23种）和羽苔科（19种）。 通过对这些种地理成分的统计，发现秦岭苔类的地理成分以北温带成分为主，占35.05%；其次是东亚成分占到31.78%，这两种地理成分在秦岭占了很大比例，高达66.83%。热带成分相对较少，有22种，占到10.29%。对于苔类来说，中国特有成分在秦岭地区较多，已知有34种，占到15.89%。说明秦岭地区苔类地理成分以温带为主，热带成分占少量比例，且秦岭地区的特有性也比较高。 文章第二部分是对中国剪叶苔属Herbertus S. Gray的分类学修订。剪叶苔属隶属于剪叶苔科，是一个古老而自然的类群，广泛分布于热带和南北温带地区。剪叶苔属植物由于其叶横生或近于横生，侧叶2裂，腹叶2裂或部分不对称3裂，并具假肋，叶细胞具大的三角体而明显区别于苔类的其它属。虽然这个属的概念比较清楚，但在属内种间的划分上存在较大的问题，是苔类中分类较混乱的一个类群。剪叶苔属种的概念多基于叶片形态，包括裂瓣的顶端细胞和假肋的形态及叶基盘边缘附属物的形态。但这些形态特征具很大的可塑性，性状不稳定，造成该属种的概念很模糊。目前全世界剪叶苔属约100余种。中国剪叶苔属的种类尚不确定，《中国苔藓志》中报道了中国有25种l亚种，但Juslen在2006年对亚洲剪叶苔属的修订中，提到中国分布的仅有6种。二者的研究中都存在有一些疏漏和不足之处，对有些种还有争议；且他们的研究中引证的标本都很少，不能全面反映中国剪叶苔属的种类和分布情况。 本研究着手于中国的剪叶苔属，从模式标本入手，从模式标本入手，结合对前人文献中引证标本的查阅，并检视了全国各大标本馆收藏的大量该属的普通标本，对于分类归并上有争议的种，采用扫描电镜和分子生物学的手段进行实验性的研究，对中国的剪叶苔属进行一个全面系统的分类学修订。期望通过本研究，明确中国剪叶苔属的种类和分布情况，为东亚乃至世界剪叶苔属的分类修订提供一份翔实的资料。共查阅了剪叶苔属26个种的模式标本，并检视了中科院北京植物研究所、华南植物园和深圳仙湖植物园馆藏的大量该属植物标本，约600余份。 通过本研究，提出2个新异名：将H. buchii Juslén和H. longispinus var calvs Massalongo处理为H. dicranus (Taylor) Trevis.；将樱井剪叶苔H. sakuraii (Warnst.) S. Hatt.（原并入H. dicranus）和H. minimus Horik.（原并入H. dicranus）重新提出；发现1个中国新分布：H. setigerus (Steph.) H. A. Mill.；确认中国的剪叶苔属17种1亚种：剪叶苔H. aduncus (Dicks.) Gray，剪叶苔纤细亚种H. aduncus subsp. tenuis (A. Evans) H. A. Mill.et E. B. Bohrer，H. armitanus (Steph.) H. A. Mill.，南亚剪叶苔H. ceylanicus (Steph.) Abeyw.，长角剪叶苔H. dicranus (Taylor) Trevis.，高氏剪叶苔H. gaochienii Fu，广东剪叶苔H. guangdongii P.J. Lin & Piippo，卵叶剪叶苔H. herpocladioides Scott. et. Miller，红枝剪叶苔H. huerlimannii Miller，细指剪叶苔H. kurzii (Steph.) H. A. Mill.，长肋剪叶苔H. longifissus Steph.，长刺剪叶苔H. longispinus Jack et Steph.，H. minimus Horik.，长茎剪叶苔H. parisii (Steph.) H. A. Mill.，多枝剪叶苔H. ramosus (Steph.) H. A. Mill.，樱井剪叶苔H. sakuraii (Warnst.) S. Hatt.，短叶剪叶苔H. sendtneri (Nees) Lindb.和H. setigerus (Steph.) H. A. Mill.。本研究还在扫描电镜下观察了H. armitanus、长角剪叶苔H. dicranus和多枝剪叶苔H. ramosus的孢子形态。对于剪叶苔属的修订，还需要更多模式标本的借阅，随着研究深入，剪叶苔属的种类可能会有大量的减少，中国剪叶苔属的种类也将会有一定的减少。