Identificação molecular de fungos endofíticos de Vochysia divergens Pohl (Vochysiaceae) do Pantanal Sul-Mato-Grossense e controle biológico de Phyllosticta citricarpa

Orientadora : Profª Drª Chirlei Glienke

Coorientadora : Profª Drª Yvelise Maria Possiede

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética. Defesa: Curitiba, 28/02/2012

Inclui referências : f. 22-31;59-68;89-92

Área de concentração

Resumo: Os fungos endofíticos, ou endófitos, pertencem a uma das Classes de fungos que apresentam grande riqueza e ampla distribuição, e, além disso, são capazes de produzir uma enorme variedade de metabólitos que podem ser aplicados nos mais diversos setores da sociedade. O estudo destes microrganismos em áreas remotas ainda é escasso, a exemplo da região do Pantanal sul-mato-grossense, que apresenta características biogeográficas únicas. Uma das particularidades da região são as formações monodominantes de Vochysia divergens, popularmente conhecido como Cambará, este vegetal de porte arbóreo também é capaz de produzir substâncias bioativas importantes. O estudo da comunidade de fungos endofíticos em folhas de Cambarás da região pantaneira pode revelar novas espécies de microrganismos com aplicação biotecnológica, como o controle biológico de Phyllosticta citricarpa, causador da doença Mancha Preta do Citros (MPC). Este fitopatógeno é o responsável por severas barreiras fitossanitárias impostas pelos países importadores que ainda estão livres da doença, o que resulta em grandes perdas econômicas para o Brasil. O uso de técnicas moleculares na identificação de fungos endofíticos tem-se revelado útil, a exemplo destas ferramentas está o sequenciamento das regiões ITS do rDNA. No presente estudo, 81 isolados tiveram seu DNA extraído e amplificaram a região do gene ITS1 - 5,8S - ITS2 do rDNA e de acordo com a análise de máxima verossimilhança os isolados foram agrupados em dois filos, quatro Classes e quinze gêneros do Reino Fungi. De 70 isolados testados contra o fitopatógeno P. citricarpa, três apresentaram resultados inibitórios promissores, e após a estratificação dos metabólitos o isolado pertencente a família Xylariaceae inibiu cerca de 80% o crescimento micelial e formação de picnídios do fitopatógeno. O gene LSU dos três isolados com maior inibição foi sequenciado para confirmação da identificação via sequencias da região ITS do rDNA. Palavras-chave: endofíticos, V. divergens, P. citricarpa, ITS e antagonismo.

Abstract: The endophytes are one class of fungi that possess a great richness and wide geographical distribution and in addition to this are capable to produce a large variety of metabolites that can be applied in several society fields. The surveys of these microorganisms in distant and isolated geographical areas are scarce; one example is the Pantanal of Mato Grosso do Sul, which own unique biogeographical characteristics and one of those peculiarities are the monodominant formations of Vochysia divergens, popularly known as "Cambará"; this vegetable is a tree also capable to produce many kinds of bioactive compounds. The study of the fungal endophytes in the "Cambará" leaf from the Pantanal region may lead to the discovery of new microorganism species with biotechnological application, as an example, the biological control of the pathogen Phyllosticta citricarpa, the responsible for the disease known as Citrus Black Spot (CBS). This phytopathogen is the cause of many phytosanitary barriers imposed by the foreign buyers free from the disease leading to great economics losses for Brazil. The application of molecular technics in the identification of fungal endophytes has proved useful, for example, the rDNA ITS regions sequencing. In the present work 81 isolates had their DNA extracted and amplified the region gene ITS1 - 5.8 S - ITS2 of the rDNA and according to maximum likelihood analysis isolates were grouped into two phyla, four Classes and fifteen genres of the Fungi Kingdom. 70 isolates were tested against the plant pathogen P. citricarpa. Three isolated showed promising results, and after the stratification of the metabolites the isolated belonging to the family Xylariaceae inhibited about 80% of mycelial growth and pycnidia formation of the pathogen. The LSU gene of three isolates with the greatest inhibition was sequenced to confirm the results of ITS. Key words: endophytes, V. divergens, P. citricarpa, ITS and antagonism.