Basis set superposition error effects, excited-state potential energy surface and photodynamics of thymine


Autoria(s): Asturiol Bofill, David
Contribuinte(s)

Universitat de Girona. Institut de Química Computacional

Data(s)

05/02/2010

Resumo

En aquesta tesi he estudiat l'efecte de l'error de superposició de base (BSSE) en la planaritat d'algunes molècules. He observat que l'ús d'alguns mètodes de càlcul amb determinades funcions de base descriuen mínims d'energia no planars per les bases nitrogenades de l'ADN. He demostrat que aquests problemes es poden arreglar utilitzant el mètode Counterpoise per corregir el BSSE en els càlculs. En aquesta tesi també he estudiat la fotofísica de la timina i els resultats mostren que existeixen dos camins de relaxació des de l'estat excitat que permeten la regeneració de l'estructura inicial de forma ultraràpida.

The effect of the basis set superposition error (BSSE) on the planarity of some molecules has been studied in this thesis. I have observed that the use of some correlated methods with certain basis sets lead to non-planar minima structures of nucleobases. I have shown that the use of the Counterpoise method fixes these pitfalls in all cases. I have also studied the photophysics of thymine in this thesis and my results show that there exist two decay paths that can regenerate the initial structure of thymine in less than tenths of picoseconds upon photon absorption.

Formato

application/pdf

Identificador

9788469319901

DL Gi.322-2010

http://www.tdx.cat/TDX-0305110-113416

http://hdl.handle.net/10803/7943

http://hdl.handle.net/10256/4871

Idioma(s)

eng

Publicador

Universitat de Girona

Direitos

ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.

info:eu-repo/semantics/openAccess

Fonte

TDX (Tesis Doctorals en Xarxa)

Palavras-Chave #Photophysics #Fotofísica #Thymine #Timina #Counterpoise method #Método Counterpoise #Mètode Counterpoise #Set superposition error #Error de superposición de base #Error de superposició de base #544 - Química física
Tipo

info:eu-repo/semantics/doctoralThesis

info:eu-repo/semantics/publishedVersion