光周敏感核不育水稻phyA基因的RFLP分析

本文用RFLP方法分析农垦58和光敏核不育水稻农垦58S以及其他一些水稻品种如IR36等，得到如下结果： 1．以第5染色体上8个RFLP标记(RG】3、RG】19、RG470、RG573、RG360、RG403、RG229、RG556)作探针对58和58S进行RFLP分析．没有发现多态性。 2． 58和58S光敏色素(phyA)基因内部（或附近）一些CpG岛的甲基化程度不同。 以IR36 phyA 基因的c DNA克隆作探针，用限制性内切酶EcoRV、Dra I、HindⅢ、Xba工、BglⅡ、Sca工、Msp工对58和58S进行RFLP分析，没有发现多态性，但用HpaII现了多态性。 3．根据IR36 ph yA序列，在5’一非编码区设计一对PCR引物，在IR36、58、58S等水稻品种中均扩出了一段DNA，此DNA片段大小在这几个不同品种中都相同。以此DNA片段（称为PCRI）作探针进行RFLP分析．发现在58S和IR36之间具有多态性，根据测出的58S的PCRI序列以及RFLP分析结果，推测58S和IR36之间的差异是由于插入或缺失引起的。