Meta-analyses identify 13 loci associated with age at menopause and highlight DNA repair and immune pathways


Autoria(s): Stolk, L.; Perry, J. R.; Chasman, D. I.; He, C.; Mangino, M.; Sulem, P.; Barbalic, M.; Broer, L.; Byrne, E. M.; Ernst, F.; Esko, T.; Franceschini, N.; Gudbjartsson, D. F.; Hottenga, J. J.; Kraft, P.; McArdle, P. F.; Porcu, E.; Shin, S. Y.; Smith, A. V.; van Wingerden, S.; Zhai, G.; Zhuang, W. V.; Albrecht, E.; Alizadeh, B. Z.; Aspelund, T.; Bandinelli, S.; Lauc, L. B.; Beckmann, J. S.; Boban, M.; Boerwinkle, E.; Broekmans, F. J.; Burri, A.; Campbell, H.; Chanock, S. J.; Chen, C.; Cornelis, M. C.; Corre, T.; Coviello, A. D.; d'Adamo, P.; Davies, G.; de Faire, U.; de Geus, E. J.; Deary, I. J.; Dedoussis, G. V.; Deloukas, P.; Ebrahim, S.; Eiriksdottir, G.; Emilsson, V.; Eriksson, J. G.; Fauser, B. C.; Ferreli, L.; Ferrucci, L.; Fischer, K.; Folsom, A. R.; Garcia, M. E.; Gasparini, P.; Gieger, C.; Glazer, N.; Grobbee, D. E.; Hall, P.; Haller, T.; Hankinson, S. E.; Hass, M.; Hayward, C.; Heath, A. C.; Hofman, A.; Ingelsson, E.; Janssens, A. C.; Johnson, A. D.; Karasik, D.; Kardia, S. L.; Keyzer, J.; Kiel, D. P.; Kolcic, I.; Kutalik, Z.; Lahti, J.; Lai, S.; Laisk, T.; Laven, J. S.; Lawlor, D. A.; Liu, J.; Lopez, L. M.; Louwers, Y. V.; Magnusson, P. K.; Marongiu, M.; Martin, N. G.; Klaric, I. M.; Masciullo, C.; McKnight, B.; Medland, S. E.; Melzer, D.; Mooser, V.; Navarro, P.; Newman, A. B.; Nyholt, D.R.; Onland-Moret, N. C.; Palotie, A.; Pare, G.; Parker, A. N.; Pedersen, N. L.; Peeters, P. H.; Pistis, G.; Plump, A. S.; Polasek, O.; Pop, V. J.; Psaty, B. M.; Raikkonen, K.; Rehnberg, E.; Rotter, J. I.; Rudan, I.; Sala, C.; Salumets, A.; Scuteri, A.; Singleton, A.; Smith, J. A.; Snieder, H.; Soranzo, N.; Stacey, S. N.; Starr, J. M.; Stathopoulou, M. G.; Stirrups, K.; Stolk, R. P.; Styrkarsdottir, U.; Sun, Y. V.; Tenesa, A.; Thorand, B.; Toniolo, D.; Tryggvadottir, L.; Tsui, K.; Ulivi, S.; van Dam, R. M.; van der Schouw, Y. T.; van Gils, C. H.; van Nierop, P.; Vink, J. M.; Visscher, P. M.; Voorhuis, M.; Waeber, G.; Wallaschofski, H.; Wichmann, H. E.; Widen, E.; Wijnands-van Gent, C. J.; Willemsen, G.; Wilson, J. F.; Wolffenbuttel, B. H.; Wright, A. F.; Yerges-Armstrong, L. M.; Zemunik, T.; Zgaga, L.; Zillikens, M. C.; Zygmunt, M.; Study, T. L.; Arnold, A. M.; Boomsma, D. I.; Buring, J. E.; Crisponi, L.; Demerath, E. W.; Gudnason, V.; Harris, T. B.; Hu, F. B.; Hunter, D. J.; Launer, L. J.; Metspalu, A.; Montgomery, G. W.; Oostra, B. A.; Ridker, P. M.; Sanna, S.; Schlessinger, D.; Spector, T. D.; Stefansson, K.; Streeten, E. A.; Thorsteinsdottir, U.; Uda, M.; Uitterlinden, A. G.; van Duijn, C. M.; Volzke, H.; Murray, A.; Murabito, J. M.; Visser, J. A.; Lunetta, K. L.
Data(s)

2012

Resumo

To newly identify loci for age at natural menopause, we carried out a meta-analysis of 22 genome-wide association studies (GWAS) in 38,968 women of European descent, with replication in up to 14,435 women. In addition to four known loci, we identified 13 loci newly associated with age at natural menopause (at P < 5 x 10(-8)). Candidate genes located at these newly associated loci include genes implicated in DNA repair (EXO1, HELQ, UIMC1, FAM175A, FANCI, TLK1, POLG and PRIM1) and immune function (IL11, NLRP11 and PRRC2A (also known as BAT2)). Gene-set enrichment pathway analyses using the full GWAS data set identified exoDNase, NF-kappaB signaling and mitochondrial dysfunction as biological processes related to timing of menopause.

Identificador

http://eprints.qut.edu.au/91838/

Publicador

Nature Publishing Group

Relação

DOI:10.1038/ng.1051

Stolk, L., Perry, J. R., Chasman, D. I., He, C., Mangino, M., Sulem, P., Barbalic, M., Broer, L., Byrne, E. M., Ernst, F., Esko, T., Franceschini, N., Gudbjartsson, D. F., Hottenga, J. J., Kraft, P., McArdle, P. F., Porcu, E., Shin, S. Y., Smith, A. V., van Wingerden, S., Zhai, G., Zhuang, W. V., Albrecht, E., Alizadeh, B. Z., Aspelund, T., Bandinelli, S., Lauc, L. B., Beckmann, J. S., Boban, M., Boerwinkle, E., Broekmans, F. J., Burri, A., Campbell, H., Chanock, S. J., Chen, C., Cornelis, M. C., Corre, T., Coviello, A. D., d'Adamo, P., Davies, G., de Faire, U., de Geus, E. J., Deary, I. J., Dedoussis, G. V., Deloukas, P., Ebrahim, S., Eiriksdottir, G., Emilsson, V., Eriksson, J. G., Fauser, B. C., Ferreli, L., Ferrucci, L., Fischer, K., Folsom, A. R., Garcia, M. E., Gasparini, P., Gieger, C., Glazer, N., Grobbee, D. E., Hall, P., Haller, T., Hankinson, S. E., Hass, M., Hayward, C., Heath, A. C., Hofman, A., Ingelsson, E., Janssens, A. C., Johnson, A. D., Karasik, D., Kardia, S. L., Keyzer, J., Kiel, D. P., Kolcic, I., Kutalik, Z., Lahti, J., Lai, S., Laisk, T., Laven, J. S., Lawlor, D. A., Liu, J., Lopez, L. M., Louwers, Y. V., Magnusson, P. K., Marongiu, M., Martin, N. G., Klaric, I. M., Masciullo, C., McKnight, B., Medland, S. E., Melzer, D., Mooser, V., Navarro, P., Newman, A. B., Nyholt, D.R., Onland-Moret, N. C., Palotie, A., Pare, G., Parker, A. N., Pedersen, N. L., Peeters, P. H., Pistis, G., Plump, A. S., Polasek, O., Pop, V. J., Psaty, B. M., Raikkonen, K., Rehnberg, E., Rotter, J. I., Rudan, I., Sala, C., Salumets, A., Scuteri, A., Singleton, A., Smith, J. A., Snieder, H., Soranzo, N., Stacey, S. N., Starr, J. M., Stathopoulou, M. G., Stirrups, K., Stolk, R. P., Styrkarsdottir, U., Sun, Y. V., Tenesa, A., Thorand, B., Toniolo, D., Tryggvadottir, L., Tsui, K., Ulivi, S., van Dam, R. M., van der Schouw, Y. T., van Gils, C. H., van Nierop, P., Vink, J. M., Visscher, P. M., Voorhuis, M., Waeber, G., Wallaschofski, H., Wichmann, H. E., Widen, E., Wijnands-van Gent, C. J., Willemsen, G., Wilson, J. F., Wolffenbuttel, B. H., Wright, A. F., Yerges-Armstrong, L. M., Zemunik, T., Zgaga, L., Zillikens, M. C., Zygmunt, M., Study, T. L., Arnold, A. M., Boomsma, D. I., Buring, J. E., Crisponi, L., Demerath, E. W., Gudnason, V., Harris, T. B., Hu, F. B., Hunter, D. J., Launer, L. J., Metspalu, A., Montgomery, G. W., Oostra, B. A., Ridker, P. M., Sanna, S., Schlessinger, D., Spector, T. D., Stefansson, K., Streeten, E. A., Thorsteinsdottir, U., Uda, M., Uitterlinden, A. G., van Duijn, C. M., Volzke, H., Murray, A., Murabito, J. M., Visser, J. A., & Lunetta, K. L. (2012) Meta-analyses identify 13 loci associated with age at menopause and highlight DNA repair and immune pathways. Nature Genetics, 44(3), pp. 260-268.

Fonte

Faculty of Health; Institute of Health and Biomedical Innovation

Palavras-Chave #Age Factors #DNA Helicases/genetics #DNA Primase/genetics #DNA Repair/*genetics #DNA Repair Enzymes/genetics #DNA-Directed DNA Polymerase/genetics #European Continental Ancestry Group/genetics #Exodeoxyribonucleases/genetics #Female #Genetic Loci/*genetics #Genome-Wide Association Study #Humans #Immunity/*genetics #Menopause/*genetics/physiology #Polymorphism #Single Nucleotide/*genetics #Proteins/genetics
Tipo

Journal Article